輪郭を散布図で表す．

前提・実現したいこと

実験データの画像解析にopencvを利用しようとしています．
画像から輪郭を抽出し，正しく輪郭を抽出できているか確認するために輪郭の座標データを散布図にプロットしています．

発生している問題・エラーメッセージ

コードを実行すると，左図のような輪郭が抽出され，右図の散布図とは定性的に異なります．
これは，正しく輪郭の座標を取得できているのでしょうか？また，できていない場合改善策を教えていただきたいです．

エラーメッセージ

該当のソースコード

import cv2
import numpy as np
import csv
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
from matplotlib.patches import Polygon
import glob
import pylab

img = cv2.imread('D:/github/sample/python/opencv/laplacian/bubble2.tif')

gray = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_RGB2GRAY)

#grayを閾値処理
thresh = cv2.threshold(gray, 210, 255, cv2.THRESH_BINARY)[1]

dst = cv2.Laplacian(thresh, cv2.CV_32F, ksize=3)

#dstをFloat64からuint8に変換
dst_uint8 = dst.astype(np.uint8)

#dstから輪郭検出
_,contours,hierarchy = cv2.findContours(dst_uint8.copy(), cv2.RETR_LIST, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)

#輪郭をそのまま書き込み
areaframe = cv2.drawContours(img, contours,-1,(0,255,0),1)


x_list = []
y_list = []
for i in range(0, len(contours)):
    if len(contours[i]) > 0:
        cv2.polylines(img, contours[i], True, (0, 255, 0), 1)
        buf_np = contours[i].flatten() # numpyの多重配列になっているため、一旦展開する。
        #print(buf_np)
        for i, elem in enumerate(buf_np):
            if i%2==0:
                x_list.append(elem)
            else:
                y_list.append(elem*(-1))
                

plt.scatter(x_list, y_list) 
print(x_list)
print(y_list)


cv2.waitKey(0)
cv2.destroyAllWindows()