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R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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共有ライブラリ '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so' を読み込めません:

AHan

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R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2020/07/15 19:44

前提・実現したいこと

R初心者です。数時間前までは問題なくパッケージインストールできていたのですが、
R でパッケージインストールを実行するとRcppを読み込めないとのメッセージがでてインストールできません。

発生している問題・エラーメッセージ

#library(Rcpp) エラー: package or namespace load failed for ‘Rcpp’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...): 共有ライブラリ '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so' を読み込めません: dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so, 6): Symbol not found: _EXTPTR_PTR Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so Expected in: /Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib/libR.dylib in /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so 追加情報: 警告メッセージ: パッケージ ‘Rcpp’ はバージョン 4.0.2 の R の下で造られました #library(umap) エラー: package or namespace load failed for ‘umap’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...): 共有ライブラリ '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so' を読み込めません: dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so, 6): Symbol not found: _EXTPTR_PTR Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so Expected in: /Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib/libR.dylib in /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so

該当のソースコード

R

1library(Rcpp) 2library(umap) 3library(tidyverse)

試したこと

Rcppを再インストールし
URL 'https://cran.ism.ac.jp/bin/macosx/contrib/4.0/Rcpp_1.0.5.tgz' を試しています
Content type 'application/x-gzip' length 3215939 bytes (3.1 MB)

downloaded 3.1 MB

ダウンロードされたパッケージは、以下にあります
/var/folders/sg/v6w1wzcn0xj71yw8xlrj43hm0000gn/T//RtmpXl9GPw/downloaded_packages

と表示されました。

/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/libs/Rcpp.so
はFinder上で確認できています。

library(RColorBrewer)
library(ggplot2)
等は普通に動きます
ディレクトリはユーザーディレクトリです。
getwd()
[1] "/Users/*******"

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

zshで
R CMD build catch22
R CMD INSTALL catch22_0.1.tar.gz
を実行しましたが、2行目で同様のエラーがでます
https://github.com/chlubba/catch22

どうぞよろしくお願いいたします。

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