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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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RとSTANでMCMCのモデルを実行しようとするとエラーが出る

ken_tauro_su

総合スコア10

R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2020/07/15 00:34

編集2020/07/15 00:44

前提・実現したいこと

R、STANは初心者です。
OSはMacです。
「RとSTANではじめるベイズ統計モデリングによるデータ分析入門」でデータ分析の勉強をしていて、第五章の5.11〜5.13あたりで参考書通りにstanファイルを作り、Rstudio上でMCMCwo実行しようとするとエラーが吐き出され、調べてみたが情報が少なく解決できないので解決したいです。
エラー解決しないと先に進めないので、お分かりになる方がいらっしゃったら教えていただけると助かります。

発生している問題・エラーメッセージ

エラーメッセージ prep_call_sampler(object) でエラー: 関数 "prep_call_sampler" を見つけることができませんでした

該当のソースコード

R,STAN ソースコード ーーーーーーーーーーRのコードーーーーーーーーーーーー mcmc_normal <- stan( file = "2-5-1-normal-dist.stan", data = data_list, seed = 1 ) ーーーーーーーーーーSTANファイルーーーーーーーーーーー data { int N; // sample size vector[N] animal_num; // data } // The parameters accepted by the model. Our model // accepts two parameters 'mu' and 'sigma'. parameters { real<lower=0> mu; // mean real<lower=0> sigma; // std } // The model to be estimated. We model the output // 'y' to be normally distributed with mean 'mu' // and standard deviation 'sigma'. model { // normal distribution mean mu, std sigma animal_num ~ normal(mu, sigma); } generated quantities{ // obtain a posterior predictive distribution vector[N] pred; for (i in 1:N) { pred[i] = normal_rng(mu, sigma); } }

試したこと

参考書のサポートページの「エラーが出たときの対応」を参考にしたが、該当する箇所がなく、stanパッケージをアンインストール→インストールをしてみたが解決しませんでした。
エラーメッセージをググってみましたが、めぼしい情報が見つけられませんでした。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

Rのバージョンです。
language R
version.string R version 3.6.2 (2019-12-12)
nickname Dark and Stormy Night

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