AWS Elastic Beanstalk 404 Not Found について　PHP

前提・実現したいこと

AWS Elastic Beanstalkでwebアプリケーションを作成しています。

表題の通り、404 Not Found に悩まされています。

FWはBEAR.sundayを使用しており、
以下の公式HPでは

ルーターの設定やスクリプトは必要なく
/done　のリクエストは　{Vendor名}{Project名}\Resource\Page\done　クラスを呼び出すとのことですが、
（Page下にDone.phpがある）

ローカル環境では、クラスが呼び出されるが、
EC2上だと　404 not foundになってしまう。
（ドキュメントルート下にdoneなんて無いというエラー）

ローカル環境の
http://localhost:8080/done?id=1
では正しくクラスが動いて処理されるが

AWSでの
http://環境名.elasticbeanstalk.com/done?id=1
では動いてくれません。

**__http://環境名.elasticbeanstalk.com/__**　での初期表示自体はできており、
doneボタンを押した時の処理になります。

アプリは以下の記事を参考にローカルで作り、
CodePipelineでElastic Beanstalkでデプロイしています。
デプロイする際に.ebextensionsフォルダにconfigファイルを置いてドキュメントルートを設定していますが
なにか他に設定するべきでしょうか。

https://polidog.jp/2016/04/29/bear/

BEAR.sunday（公式）
http://bearsunday.github.io/manuals/1.0/ja/router.html

この方法で動かせるのがベストでは有りますが、
とりあえずは何かしら別の方法で動かならば、そちらもご教授して頂けたらありがたいです。

発生している問題・エラーメッセージ

2020/06/17 13:03:09 [error] 15112#0: *2027 open() "/var/www/html/プロジェクト/delete" failed (2: No such file or directory), client: 172.32.13.253, server: , request: "GET /delete?id=1 HTTP/1.1", host: "環境"

該当のソースコード

twig
1{% extends 'layout/base.html.twig' %}
2
3{% block content %}
4    <h1 class="page-header">タスク</h1>
5    <div class="row">
6        <div class="col-sm-8">
7            <div class="panel panel-default">
8                <div class="panel-heading">タスク一覧</div>
9                <div class="panel-body">
10                    {% if todos %}
11                        <table class="table">
12                            <thead>
13                            <tr>
14                                <th>Id</th>
15                                <th>Title</th>
16                                <th>CreatedAt</th>
17                                <th> </th>
18                            </tr>
19                            </thead>
20                            <tbody>
21                            {% for todo in todos %}
22                                <tr>
23                                    <td>{{ todo.id }}</td>
24                                    <td>{{ todo.title }}</td>
25                                    <td>{{ todo.createdAt|date("Y/m/d H:i:s") }}</td>
26                                    <td>
27                                        {% if todo.status == 1 %}
28                                            <a class="btn btn-success" href="/done?id={{ todo.id }}">Done</a>
29                                            <a class="btn btn-danger" href="/delete?id={{ todo.id }}">del</a>
30                                        {% endif %}
31                                    </td>
32                                </tr>
33                            {% endfor %}
34                            </tbody>
35                        </table>
36
37                    {% else %}
38                        <div class="panel-body">
39                            <p>タスクがありません</p>
40                        </div>
41                    {% endif %}
42                </div>
43            </div>
44
45        </div>
46        <div class="col-sm-4">
47            <div class="panel panel-default">
48                <div class="panel-heading">新規作成</div>
49                <div class="panel-body">
50                    {{ todo_form|raw }}
51                </div>
52            </div>
53        </div>
54    </div>
55{% endblock %}
56
57

試したこと

href="/done"をして時に、
対象のクラスを動かすというBEARの処理がおかしいのかという点で
SSH接続でEC2に入り、その中でBEARのプロジェクトを作成
それを一度ローカルに持って行き、対象のソースを修正して再度EC2にデプロイしましたが、変わりませんでした。
composer create-project -n bear/skeleton MyVendor.MyProject