デフォルトパッケージの関数との衝突について

Question

MacでRを使っています。
新たにパッケージをインストールすると、一部の関数がデフォルトパッケージの既存の関数と衝突して使えない（マスクされてしまう）ことがちょくちょくあります。
statsやbaseなどのデフォルトパッケージはパッケージインストーラーからの検索で出て来ず、インストールできないので、極力アンインストールしたくないです。（install.pakeges()でもインストールできません。）

先日statsの関数とdplyrの関数filter()が衝突し、dplyrのfilter()を使うためにstatsをアンインストールしたのですが、その後statsが再インストールできないことに気づき、結局R自体をアップデートして取り戻しました。
この方法はいちいち手間がかかるし、インストールしていた細かな依存パッケージがすべて消えてしまったりするので、正攻法ではないような気がします。

みなさんはこのように、デフォルトパッケージの関数と衝突してしまった場合、どのように解決しているのでしょうか。
もしくは、stats等を単体で直接再インストールする方法があるのでしょうか。

Answer 1

Rパッケージのバージョン依存性は本当に面倒くさいです。パッケージ同士の衝突もあるし、R本体とのバージョンの相性もあります。
正直のところ、Rだけを使っている限り、特効薬はないと考えています。

最近Dockerを導入しました。Rパッケージを新たに導入するたびに新しいDockerFileを作成し、それぞれ用の個別の仮想環境を作る勢いです。とうぜんディスク容量がそれだけ圧迫されますが、そこはHDDを増設して乗り切ればいい。融通の利かないRへの対処に費やす不毛な時間を考えれば安いコストだと考えています。

Comments

[kyrie]

回答ありがとうございます。
参考にさせていただきます。