ncbi-blast+がコマンドプロンプトに「十分な空き領域がない」エラーを返す

Question

コマンドプロンプトからncbi-blast+のmakeblastdbを実行すると、「Error: mdb_env_open: ディスクに十分な空き領域がありません。」が返り実行できない。

同じコマンドをWindows Subsystem for Linuxで動かしているUbuntu bash上で実行すると、エラーはおきず正常に実行されます。

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実行したコード

makeblastdb -in hoge.fasta -out hogehoge -dbtype nucl -parse_seqids

実行結果

Building a new DB, current time: 05/13/2020 23:13:03
New DB name:   hogehoge
New DB title:  hoge.fasta
Sequence type: Nucleotide
Keep MBits: T
Maximum file size: 1000000000B

No volumes were created.

Error: mdb_env_open: ディスクに十分な空き領域がありません。

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このコマンドは60MBほどのfasta形式ファイルを読み込み、6つのファイルを同じディレクトリに出力します。（合計で約30MB）

なお、ディスク・メモリともに十分な空き容量はあります。
ncbi-blast+のtblastn他ローカルブラストのコマンドはコマンドプロンプト上で実行できます。

問題の原因・解決方法をご存知の方、ご教示いただけませんか。
よろしくお願いいたします。

以下バージョン名

Windows : Win 10 home ver.1909
ncbi-blast+ : 2.10.0(Win64bit版)

Ubuntu : Linux version 4.4.0-18362-Microsoft ([e-mail]) (gcc version 5.4.0 (GCC) ) #836-Microsoft Mon May 05 16:04:00 PST 2020

Answer 1

windows版特有の問題らしいです。エラーメッセージでググったらすぐに見つかりました。

https://www.biostars.org/p/413294/

This is a known issue with the Windows release. The program makeblastdb attempts to allocate a very large amount of virtual memory. You can solve the problem by setting the a new BLAST environment variable BLASTDB_LMDB_MAP_SIZE=1000000 See the BLAST setup documentation for details on how to set Windows environment variables (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK52637/). Once you change the variable, you'll need to close and reopen the command window where you were running BLAST for the new setting to take effect.

Comments

[nasudeng]

ありがとうございます！日本語文献ばかり読んでいましたが、おかげで解決策が見つかりました。
帰宅してこの方法を試しました後、質問を閉じさせていただきます。