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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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【R】vector型のアウトプットをファイル出力したい

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投稿2020/03/23 07:34

編集2020/03/23 08:59

【R】vector型のアウトプットをファイル出力したい

前提・実現したいこと

とあるグループの年度ごとのネットワーク中心性を算出していきたいと考えています。
年度ごとにループ処理をして、結果をファイルに出力したいという状況です。

  • インプットデータはdata frameで処理している。
  • 2つある中心性の結果はvector型。
  • リスト年度ごとに対象ユーザID数が異なる。
  • これらを「年度、ユーザID、次数中心性, 近接中心性」の4列にまとめてファイルに出力したい。

発生している問題・エラーメッセージ

  • 算出結果をそのままrbind
警告メッセージ: 1: rbind(deg.all, deg) で: number of columns of result is not a multiple of vector length (arg 2) 2: rbind(deg.all, deg) で: number of columns of result is not a multiple of vector length (arg 2) 3: rbind(deg.all, deg) で: number of columns of result is not a multiple of vector length (arg 2)
  • 算出結果(vector型)をarray, matrix, dataframe等に変換してrbind
rbind(deparse.level, ...) でエラー: 引数の列の数が一致しません
  • パッケージdplyrを用いて、算出結果(vector型)をarray, matrix, dataframe等に変換してbind_rows
エラー: Argument 1 must have names

該当のソースコード

R

1install.packages("igraph") 2library(igraph) 3 4install.packages("dplyr") 5library(dplyr) 6 7d <- read.csv(file='res_0322_test.csv', header=T, sep=",", fileEncoding = "UTF-8") 8 9year_list <- unique(d$year) 10c <- length(year_list) 11 12deg.all <- data.frame() 13 14c <- 1 15while(c <= length(year_list)) 16 { 17 ds <- with(d, d[year==year_list[c], , drop=F])  #年度ごとに行を抽出 18 g1 <- graph.data.frame(ds[,3:4],directed=F) #3-4列目にユーザIDの1:1のペアが入っている 19 20 #igraphの中心性指標 21  deg <- degree(g1) #次数中心性 22  clo <- closeness(g1) #近接中心性 23 24 #困っている箇所はこの辺り 25  deg <- as.matrix(deg)      26 colnames(deg) <- c("degree") 27 deg.all <- bind_rows(list(deg.all, deg)) 28 29 c <- c + 1 30 } 31 32write.csv(deg.all, "deg_test.csv")

インプット・算出結果(vector型)

  • インプット

year name_no.x name_no.y N
2016 222 758 1
2016 401 758 1
2016 758 222 1
2016 758 401 1
2017 222 758 1
2017 401 758 1
2017 401 955 2
2017 758 222 1
2017 758 401 1
2017 758 955 1
2017 955 401 2
2017 955 758 1
2018 222 758 1
2018 401 758 1
2018 401 955 2
2018 758 222 1
2018 758 401 1
2018 758 955 1
2018 955 401 2
2018 955 758 1
2019 222 758 1
2019 222 1766 1
2019 401 758 1
2019 401 1153 1
2019 758 222 1
2019 758 401 1
2019 758 1153 1
2019 758 1766 1
2019 1153 401 1
2019 1153 758 1
2019 1766 222 1
2019 1766 758 1

  • 算出結果(単純にprint(deg),print(clo)で出力したもの↓)

222 401 758
2 2 4
222 401 758
0.3333333 0.3333333 0.5000000

222 401 758 955
2 4 6 4
222 401 758 955
0.2000000 0.2000000 0.3333333 0.2000000

222 401 758 955
2 4 6 4
222 401 758 955
0.2000000 0.2000000 0.3333333 0.2000000

222 401 758 1153 1766
4 4 8 4 4
222 401 758 1153 1766
0.1666667 0.1666667 0.2500000 0.1666667 0.1666667

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先に「expand.grid」でアウトプットを入力するdataframeを作成しておき、
算出結果を代入していくように処理することにしました。

list_year <- unique(d$year) list_name_no <- unique(d$name_no.x) eg <- expand.grid(list_year, list_name_no) df_output <- data.frame(year = eg$Var1, name_no = eg$Var2, deg = -1)

投稿2020/03/23 14:11

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