nginxのhttps化について。

Question

nginxのhttps化について。
nginxのsyntax_checkをしてみたところ、
(botenv) [nginx]# nginx -t
nginx: [emerg] cannot load certificate "/etc/letsencrypt/live/mydomain.com/fullchain.pem": BIO_new_file() failed (SSL: error:02001002:system library:fopen:No such file or directory:fopen('/etc/letsencrypt/live/mydomain.com/fullchain.pem','r') error:2006D080:BIO routines:BIO_new_file:no such file)
nginx: configuration file /etc/nginx/nginx.conf test failed

上のようなエラーが出てしまいます。
かなりググっていますが、原因が分からず迷っています。原因のわかる方、是非ご教授願います。

環境
Mac OS Catalina
さくらvps（CentOS7）

Comments

[hoshi-takanori]

/etc/letsencrypt/live/mydomain.com/fullchain.pem というファイルが見当たらないようですが、Let's Encrypt はどうやって設定しましたか？

[adrastea]

さくらvpsのos再インストール時にスタートアップスクリプトという機能を使ってletsencryptを設置しました

[hoshi-takanori]

mydomain.com の部分は、ご自分で取得した正しいドメイン名になってますか？

[adrastea]

もちろんしてあります。あと、/etc/letsencrypt/live/mydomain.com/fullchain.pemはありました。

[adrastea]

(botenv) [/]# cd /etc/letsencrypt/
(botenv) [letsencrypt]# ls
accounts archive csr keys live renewal renewal-hooks
(botenv) [letsencrypt]# cd live
(botenv) [live]# ls
README xxxxxxxxx.com
(botenv) [live]# cd xxxxxxxxxx.com
(botenv) [xxxxxxxxx.com]# ls
README cert.pem chain.pem fullchain.pem privkey.pem

[hoshi-takanori]

もしかして普段から root でログインして virtualenv をお使いなんですね。certbot は python で書かれてるので、virtualenv が干渉してる可能性がありそう…。

[adrastea]

https://qiita.com/mahiroaug/items/b0e23e6ca19c33add1a9
普段からというより、↑のサイトを参考にしていてvirtualenvを使っていました。
rootでログインしっぱなしなのは、避けるようにはしていますが、よくやってしまいます…