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ImageJでスタックをtxtファイルとして保存するマクロ

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konishi04

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ImageJを使ってスタック画像のすべてのスライスにおいて「File > Save As > Text Image」を行い、txtファイルとして保存するマクロの作成。また、1枚目から順に1,2,3,...と名前を付けて保存したい。

発生している問題・エラーメッセージ

setSlice(1)
saveAs("Text Image","保存先/1(保存名).txt");
任意のスライス枚数のスタック画像におけるすべてのスライスについて上記の操作を1枚目のスライスは1という名前で、2枚目のスライスは2という名前で順に保存するマクロの組み方がわからない。

該当のソースコード

ImageJ IJ1 Macro

試したこと

open("保存場所/保存名.tif");
frames=nSlices;
for(k=0;k<frames;k+=1){
currentslice=k+1;
setSlice(currentslice);
saveAs("Text Image", "保存場所/k.txt");
}
このマクロだと、forループが保存するときの名前に反映されない。また、10枚のスライスならsetSliceを10枚すべてに行った後にsaveAs()を行っている。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

マクロ言語を学び始めて1か月程度で、わからないことだらけです。

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  • asahina1979

    2019/05/26 21:24

    kは文字列

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  • fiwa

    2019/06/03 21:47

    Save As > Image Sequences ... で format を Text に指定してやればよいのでは

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