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「シリンダー」と言う単語が使われるようになったのは、両面のディスクを1枚以上持つHDDが出てきたころからです。どちらかと言うと論理的な意味合いで使われるもの（と私は認識しています）で、トラックを積み重ねると、まさに円筒状のシリンダーのイメージが出来上がる為にそう呼ばれます。
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過去、HDD上で読みたい場所（セクター）を指定するのに、HDDのインターフェースとしてCHS(Cylinder/Head/Sector)方式が使われていました。これはそのまま、シリンダー、ヘッド、セクターの3つの位置情報をセットにして読み出し／書き込みを指定するもので、PCのディスクBIOSにその名ごりを伺い知ることができます。
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[INT 13h AH=02h: Read Sectors From Drive](https://en.wikipedia.org/wiki/INT_13H#INT_13h_AH=02h:_Read_Sectors_From_Drive)
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