CodeIgniter2で重複したSet-Cookieが送られてしまう

###前提
CodeIgniter2で運用中のサービスです。
セッション機構として、CodeIgniterデフォルトのCookie利用の仕組みを使っています。

###発生している問題
レスポンスヘッダが長くなりすぎる（4KB超）ことでインフラ側に問題が発生しています。
PHPでデバッグしながら確認してみると、
セッションライブラリの初期化や、
$this->session->set_userdata の呼出タイミングで、
都度PHPのsetcookieが呼ばれているようで、セッションのSet-Cookie（内容もほとんど重複）が複数のSet-Cookie: としてヘッダーに含まれて送信されています。

###該当のソースコード
system/libraries/Session.php（CodeIgniterのデフォルト）

PHP
1
2	/**
3	 * Write the session cookie
4	 *
5	 * @access	public
6	 * @return	void
7	 */
8	function _set_cookie($cookie_data = NULL)
9	{
10		if (is_null($cookie_data))
11		{
12			$cookie_data = $this->userdata;
13		}
14
15		// Serialize the userdata for the cookie
16		$cookie_data = $this->_serialize($cookie_data);
17
18		if ($this->sess_encrypt_cookie == TRUE)
19		{
20			$cookie_data = $this->CI->encrypt->encode($cookie_data);
21		}
22
23		$cookie_data .= hash_hmac('sha1', $cookie_data, $this->encryption_key);
24
25		$expire = ($this->sess_expire_on_close === TRUE) ? 0 : $this->sess_expiration + time();
26
27		// Set the cookie
28		setcookie(
29			$this->sess_cookie_name,
30			$cookie_data,
31			$expire,
32			$this->cookie_path,
33			$this->cookie_domain,
34			$this->cookie_secure
35		);
36	}

この_set_cookie()が初期化やset_userdataの都度呼ばれています。

またconfig.php内のセッション関連の設定は以下の通りです。

PHP
1$config['sess_cookie_name']		= 'ci_session';
2$config['sess_expiration']		= 7200;
3$config['sess_expire_on_close']	= TRUE;
4$config['sess_encrypt_cookie']	= TRUE;
5$config['sess_use_database']	= FALSE;
6$config['sess_table_name']		= 'ci_sessions';
7$config['sess_match_ip']		= FALSE;
8$config['sess_match_useragent']	= TRUE;
9$config['sess_time_to_update']	= 300;

###試したこと
検証用コントローラを作ってシンプルなコードで呼び出しましたが、現象は変わりませんでした。
また、同様の報告を探しましたが見つかりませんでした。

###その他
運用中のサービスのため、セッション機構自体を大幅な変更（Cookie→DBにする、自前のセッションを利用する、等）は避けたいです。
RFC 6265でも「サーバは、同じ応答内に同じ cookie-name の複数の Set-Cookie ヘッダを内包するべきでない」との記載があり、
上述の挙動がCIの仕様とも考えにくいので、何らか対策が可能ではと思うのですが、ご存知の方いらっしゃらないでしょうか。
よろしくお願いいたします。