Content-encoding-gzip
のIE11の不具合は無視するしかないと思います。
Gzip転送自体、有効にしたから爆速!というわけでもないですし。
ApacheのDeflate
モジュールが使えないとかでしたら、しかたがないと思いますが、PHPでgzip転送するよりApacheに任せたほうが良いと思います。
apache
1## public/.htaccess
2<IfModule mod_deflate.c>
3 SetOutputFilter DEFLATE
4 SetEnv force-gzip
5 BrowserMatch ^Mozilla/4 gzip-only-text/html
6 BrowserMatch ^Mozilla/4\.0[678] no-gzip
7 BrowserMatch \bMSIE !no-gzip !gzip-only-text/html
8 SetEnvIfNoCase Request_URI \.(?:gif|jpe?g|png|ico|eot|woff|woff2|ttf|otf|pdf)$ no-gzip dont-vary
9 Header append Vary User-Agent env=!dont-vary
10
11 AddOutputFilterByType DEFLATE text/plain
12 AddOutputFilterByType DEFLATE text/html
13 AddOutputFilterByType DEFLATE text/xml
14 AddOutputFilterByType DEFLATE text/css
15 AddOutputFilterByType DEFLATE text/javascript
16 AddOutputFilterByType DEFLATE application/xhtml+xml
17 AddOutputFilterByType DEFLATE application/xml
18 AddOutputFilterByType DEFLATE application/rss+xml
19 AddOutputFilterByType DEFLATE application/atom_xml
20 AddOutputFilterByType DEFLATE application/javascript
21 AddOutputFilterByType DEFLATE application/x-javascript
22 AddOutputFilterByType DEFLATE image/svg+xml
23</IfModule>