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自身のプラットフォーム・プログラム・データセットに対して、外部ソースを取り込むプロセスをimportと呼びます。

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Cytoscapeでgmlファイルのimportをする際にjavaのキャストエラーが発生する

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import

自身のプラットフォーム・プログラム・データセットに対して、外部ソースを取り込むプロセスをimportと呼びます。

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投稿2017/08/12 03:19

###前提・実現したいこと
Cytoscapeでgml形式のファイルを読み込みグラフを表示させたいです。

環境
windows8
java8

###発生している問題・エラーメッセージ
file -> import -> network -> file の順にgmlファイルを読み込もうとすると、「java.lang.Integer cannot be cast to java.lang.String」というjavaのエラーが出てしまい、グラフを表示できません。

Cytoscape Task java.lang.Integer cannot be cast to java.lang.String

###該当のソースコード

あまり関係あるとは思えませんが、gmlファイルを作成した時のソースを貼ります。

python

1import community 2import networkx as nx 3G = nx.karate_club_graph() 4partition = community.best_partition(G) 5labels = dict([(i, str(i)) for i in range(nx.number_of_nodes(G))]) 6nx.set_node_attributes(G, 'label', labels) 7nx.set_node_attributes(G, 'community', partition) 8nx.write_gml(G, "community.gml") 9

###試したこと
作成したgmlファイルをgephiで読み込む -> 成功
Cytoscape上で作成したグラフをgraphmlファイルとしてエクスポートし、Cytoscape上のグラフを削除した後インポートする -> 成功

###補足情報(言語/FW/ツール等のバージョンなど)
python3系
Cytoscape3.5.1
Gephi0.9.1

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投稿2019/03/11 21:18

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