Ubuntu＋Eclipse＋PyDevで環境変数の設定を.bashrcに合わせたい

Question

###前提・実現したいこと
Ubuntu＋Eclipse＋PyDevで環境変数の設定を.bashrcに合わせたい。
下記のtest.pyをコマンド上で実行すると、

PATH=/home/XXX/bin:/home/XXX/.local/bin:/usr/local/cuda/bin:/home/XXX/anaconda3/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/snap/bin
PYTHONPATH=/usr/local/lib/python3.5/dist-packages:

しかし、Eclipse上で実行すると、

PATH=/home/XXX/bin:/home/XXX/.local/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/snap/bin
PYTHONPATH=/home/XXX/.p2/pool/plugins/org.python.pydev_5.7.0.201704111357/pysrc/pydev_sitecustomize:/home/XXX/workspace/pydev01:/home/XXX/anaconda3/lib/python3.6:/home/XXX/anaconda3/lib/python3.6/lib-dynload:/home/XXX/.local/lib/python3.6/site-packages:/home/XXX/anaconda3/lib/python3.6/site-packages:/home/XXX/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/Sphinx-1.5.1-py3.6.egg:/home/XXX/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/setuptools-27.2.0-py3.6.egg

のように差異があります。
sys.path.append()でソース上で合わせられなくもないですが、
できるだけソース上に環境依存のコードは書きたくありません。
PyDev側の設定をコマンド上で実行できる.bashrcのパス設定に合わせるにはどうすればよろしいでしょうか？

###発生している問題・エラーメッセージ

エラーメッセージ

###該当のソースコード

test.py

import os
print("PATH=" + os.environ["PATH"])
print("PYTHONPATH=" + os.environ["PYTHONPATH"])

###補足情報(言語/FW/ツール等のバージョンなど)
Ubuntu 16.04
Eclipse 4.6.3
PyDev 5.7.0

Answer 1

プロジェクトのプロパティから設定する方法で進めていきます。
ありがとうございました。

ちなみに、

これはApp Launcher経由ではなく、ターミナルからコマンドを実行してEclipseを起動すると.bashrcを反映した状態になりませんか？（未確認）

これは反映されませんでした。

Answer 2

興味を持ったので調べ始めたのですが、なかなか根が深そうなので分かる範囲の触りだけを記します。

PATHについて

これはApp Launcher経由ではなく、ターミナルからコマンドを実行してEclipseを起動すると.bashrcを反映した状態になりませんか？（未確認）

PYTHONPATHについて

ある程度は「Project -> Properties -> PyDev - PYTHONPATH」と「Window -> Preferences -> PyDev -> Interpreters -> Python Interpreter」で制御できます。

プロジェクトのプロパティ

インタプリタの設定

が、org.python.pydev_.../pysrc/pydev_sitecustomizeの根が深く、最終的にはどうやれば消せるか分かりませんでした。