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Jupyter

Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

Python 3.x

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

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2回答

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Jupyter notebookでRを実行できる環境を作りたい

rakuda1007

総合スコア6

Jupyter

Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

Python 3.x

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

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投稿2017/03/25 14:41

###前提・実現したいこと
OS:Windows7
Jupyter notebookを使って、Rを実行できる環境を作りたい

###発生している問題・エラーメッセージ

Jupyter notebookで新規notebook作成でRを指定して、
Rのコマンドを実行すると、次のようなメッセージがでる。

エラーメッセージ
Kernel Restarting
The kernel appears to have died. It will restart automatically.

###該当のソースコード
1+1

###補足情報(言語/FW/ツール等のバージョンなど)
pythonはPython 3.6.0
https://www.python.org/downloads/からインストール
※anacondaでの一括インストールはしておりません。

Rはversion 3.2.2
Rstudioもインストールしています

###試したこと

既にR(Rstudioから実行)、python(WindowsPowerShellから呼び出して実行)を利用している環境で、あらたにJupyterを利用したいということで、以下を実施。

pip install "ipython[notebook]"

この状態でJupyterからPythonを実行することはできるようになりました。

Rstudioのコンソール画面から以下をたたいた
install.packages(c('rzmq','repr','IRkernel','IRdisplay'), repos = c('http://irkernel.github.io/', getOption('repos')))

package ‘repr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
package ‘IRkernel’ successfully unpacked and MD5 sums checked
package ‘IRdisplay’ successfully unpacked and MD5 sums checked

The downloaded binary packages are in
C:XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

と表示され、うまくいったようにみえた。

Rstudioのコンソール画面から以下をたたいた
IRkernel::installspec()

[InstallKernelSpec] Removing existing kernelspec in C:\XXXXXXXX\AppData\Roaming\jupyter\kernels\ir
[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in C:\XXXXXXXX\AppData\Roaming\jupyter\kernels\ir
と表示されうまくいったようにみえる

Widows Power Shellから以下をたたく

jupyter notebook

すると、ブラウザが起動しJupyterが立ち上がる。
ここで新規作成のために「New」を選ぶとプルダウンメニューに「R」が表示される。

5.セルに「1+1」とうちCtrl+Enterをするとエラーメッセージが表示され実行できない

PythonもRもよくわかっていない状況で検討違いもあるかもしれませんが、
教えていただけると助かります。よろしくお願いいたします。

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回答2

0

以前、古い IRkernelをインストールした際におなじ現象が起きたことがあります。
試しに、githubのrepository より最新のIRkernelパッケージをインストールしてみてください。

インストールの方法は、

R

1remove.packages(c("IRkernel", "IRdisplay"))

を実行して IRkernelとIRdisplayのパッケージを削除したのち

R

1install.packages("devtools") 2 3library(devtools) 4 5install_github("IRkernel/IRdisplay") 6 7install_github("IRkernel/IRkernel")

にてgithubより直接インストールできます。

ちなみに、今日現在(2017/3/30)のパッケージのバージョンを確認したところ

R

1> packageVersion('IRdisplay') 2[1]0.4.90003> packageVersion('IRkernel') 4[1]0.8.6.9000

となっておりました。

上記のバージョンのIRKernelを使用し、
Windows7 + Python 3.5.2
の環境下で確認したところ、Jupyter Notebook / Jupyter Lab 共に問題なく R kernel が動作しております。

投稿2017/03/30 09:17

magichan

総合スコア15898

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0

自己解決

アドバイスいただいた

remove.packages(c("IRkernel", "IRdisplay"))

によるIRkernelとIRdisplayのパッケージを削除したのち、次を実行することで環境構築できました。

install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()

投稿2017/04/08 06:34

rakuda1007

総合スコア6

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