わかったようでわからないような…的を外していたらごめんなさい。
たぶん、ちゃんとAtom上でフォルダを開いていないのだと思います。
- まず、gitを入れてください。WindowsならGit for Windows、MacならHomebrewを使って入れると良いでしょう。
- 次にAtomで
atom
コマンドで起動するようにしてください。Windowsはインストーラが設定してくれたはずです。MacならメニューのAtom->Insntall Shell Commandで入ります。
- Git for Windowsのbash(ただのコマンドプロンプトでもできないこと無いけどお勧めしません)またはターミナルを開きます。適当な作業用ディレクトリに移ってください。
- GithubのページのClone or DownloadでURLをコピペして
git clone https://github.com/atom/atom.git
(これはAtomのソースコードの例)のような形でクローンします。
5. クローンが終わったらそのディレクトリ移りましょう。
6. atom .
でAtom上でそのディレクトリを開きます。
これで、一覧が見えるはずです。
あとはbundle install
するなり、git branch なんとか
するなりすると、Atom上のディレクトリツリーも変換するはずです。AtomにはRailsやgitを扱いやすくするプラグインもありますので、それらを入れるとさらに便利かも知れません。