pythonからR呼びたいがエラーになる
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PythonでRを使いたいのですが、エラーが出て解決できないでおります。
■前提
当方、機械学習を勉強するために、Python＋Rを試験実装しています。
どちらの言語も初心者です。（普段はJavaです）
■環境
Windows7 64bit
Python 3.5.2
PypeR 1.1.2
PyCharm Community Edition 2016.3
■事象
以下のようにRを呼び出していますが、エラーが出ます。
import pyper
r = pyper.R(use_pandas='True')
iris = pd.read_csv(r"C:\Users\user\Desktop\r_Sample\iris.csv")
r.assign('data', iris)
r('rlm <- lm(Sepal.Width ~ Sepal.Length + Petal.Length + Petal.Width, data=iris)')
print(r('summary(rlm)'))エラーメッセージ
C:\Python\python.exe C:/Users/user/PycharmProjects/sample/Ayame.py
Traceback (most recent call last):
File "C:/Users/user/PycharmProjects/sample/Ayame.py", line 99, in <module>
r = pyper.R(use_numpy='True', use_pandas='True')
File "C:\Python\lib\site-packages\pyper.py", line 600, in __init__
self.__dict__['prog'] = Popen(RCMD, stdin=PIPE, stdout=PIPE, stderr=return_err and _STDOUT or childstderr, startupinfo=info)
File "C:\Python\lib\subprocess.py", line 947, in __init__
restore_signals, start_new_session)
File "C:\Python\lib\subprocess.py", line 1224, in _execute_child
startupinfo)
FileNotFoundError: [WinError 2] 指定されたファイルが見つかりません。
Process finished with exit code 1どなたか解決方法をご教授頂けますでしょうか。。
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checkベストアンサー
0
質問文とエラー内容、そしてPypeRのドキュメントを読む限り、
Rをインストールしていない もしくは PyeRが想定している場所とは別にインストールしている のどちらかだと思います。
もしインストールしているのであれば、
- インストールしているコマンドを
RCMDでしていする - インストール先のパスを環境変数に含める
のどちらかが必要です。
投稿
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2016/12/12 19:35
ご回答ありがとうございます。
ご指摘の通り、Rはインストールしていたんですが、パスが通っていませんでした。
私の環境だと、環境変数に「C:\Program Files\R\R-3.3.2\bin\x64」を追加すれば、正常に実行できました。
大変助かりました。ありがとうございます。
ベストアンサーとさせて頂きます。