jupyter notebook のエラー -- pkg_resources.DistributionNotFound

jupyter notebook のエラーです。
jupyter notebook のextension を導入したところこのようなエラーがでるようになってしまいました。
また、pip,jupyter,ipythonなどはすべてpipでupgradeしたのですがダメでした。
よろしくお願いします。

sh
kagurdhcp024213% jupyter notebook                                                    ⮀ INSERT ⮀
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/jupyter-notebook", line 5, in <module>
    from pkg_resources import load_entry_point
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/pkg_resources.py", line 2603, in <module>
    working_set.require(__requires__)
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/pkg_resources.py", line 666, in require
    needed = self.resolve(parse_requirements(requirements))
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/pkg_resources.py", line 565, in resolve
    raise DistributionNotFound(req)  # XXX put more info here
pkg_resources.DistributionNotFound: ipython>=4.0.0

バージョンは以下のようになっています。

kagurdhcp024213% python -V                                                                                 
Python 2.7.5
kagurdhcp024213% ipython -V                                                                                                        
5.1.0

kagurdhcp024213% jupyter --version                                                                                                                   
4.2.0
kagurdhcp024213% pip -V                                                                                                                               
pip 9.0.1 from /usr/local/lib/python2.7/site-packages (python 2.7)

また、以下のコマンドを打ち込んでからエラーがでるようになりました。
おそらく setup.pyを実行した後の問題ではないかと思うのですが...

sh
pip install pyyaml
git clone https://github.com/ipython-contrib/IPython-notebook-extensions
cd IPython-notebook-extensions
sudo python setup.py install