jupyter notebook のエラー -- pkg_resources.DistributionNotFound

Question

jupyter notebook のエラーです。
jupyter notebook のextension を導入したところこのようなエラーがでるようになってしまいました。
また、pip,jupyter,ipythonなどはすべてpipでupgradeしたのですがダメでした。
よろしくお願いします。

kagurdhcp024213% jupyter notebook                                                    ⮀ INSERT ⮀
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/jupyter-notebook", line 5, in <module>
    from pkg_resources import load_entry_point
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/pkg_resources.py", line 2603, in <module>
    working_set.require(__requires__)
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/pkg_resources.py", line 666, in require
    needed = self.resolve(parse_requirements(requirements))
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/pkg_resources.py", line 565, in resolve
    raise DistributionNotFound(req)  # XXX put more info here
pkg_resources.DistributionNotFound: ipython>=4.0.0

バージョンは以下のようになっています。

kagurdhcp024213% python -V                                                                                 
Python 2.7.5
kagurdhcp024213% ipython -V                                                                                                        
5.1.0

kagurdhcp024213% jupyter --version                                                                                                                   
4.2.0
kagurdhcp024213% pip -V                                                                                                                               
pip 9.0.1 from /usr/local/lib/python2.7/site-packages (python 2.7)

また、以下のコマンドを打ち込んでからエラーがでるようになりました。
おそらく setup.pyを実行した後の問題ではないかと思うのですが...

pip install pyyaml
git clone https://github.com/ipython-contrib/IPython-notebook-extensions
cd IPython-notebook-extensions
sudo python setup.py install

Answer 1

インストール情報がこわれている気がします。upgradeではなく、以下のようにアンインストール&インストールをやってみてください。

$ sudo pip uninstall ipython
$ pip uninstall ipython
$ pip install ipython

また、以下のように、sudoをここだけ付けてるのはなぜでしょうか？

$ cd IPython-notebook-extensions
$ sudo python setup.py install

これが原因で、OS管理下にあるPythonのディレクトリにインストールされていると思います。
cd せずに以下のようにインストールしてみてください。

$ pip install ./IPython-notebook-extensions/

Comments

[simasima]

```
$ sudo pip uninstall ipython
$ pip uninstall ipython
$ pip install ipython
```
までは行いましたが、やはりエラーが出ます。$Ipython notebook で行うと問題なくjupyter notebook が利用できるのですが...ただ、$jupyter notebook の時と変わらず extensionは利用できません。
sudoをつけているのは、つけない場合Permission denieと怒られるためです。
また、ホームディレクトリで$ pip install ./IPython-notebook-extensions/を行ってみましたが、
Invalid requirement: './IPython-notebook-extensions/'
It looks like a path. Does it exist ?
となってしまいました。

また、
pip install pyyaml
git clone https://github.com/ipython-contrib/IPython-notebook-extensions
cd IPython-notebook-extensions
sudo python setup.py install

を行う前に
$ pip install https://github.com/ipython-contrib/IPython-notebook-extensions/archive/master.zip --user
を行っていたという背景があります。

[shimizukawa]

```
Invalid requirement: './IPython-notebook-extensions/'
It looks like a path. Does it exist ?
```
これは、そのパスが存在しないからですね。
IPython-notebook-extensions の親ディレクトリで実行してみてください。

以下、現状についての推測と補足です。

`pip install ipython` ができているのに、IPython-notebook-extensions はエラーになっていたのを考えるとおそらく以下のようになっているのだと思います。

1. Permission denied になっているのはOSのPythonのパスにユーザー権限でインストールしようとしているためでしょう。
2. pip installできているのは、ユーザー環境のどこかにPythonが別にインストールされていて、そこにインストールされるためでしょう（virtualenvかanacondaかpyenvかどれかでしょうか）。
3. pip install --user は ~/.local/ 以下にインストールされます。

そして、これらはそれぞれ別のPython環境のため、共存しません。どれか1つの環境のみで構築してみてください。
おそらく、2番の環境に入れていくのが今のところ良さそうに見えます。

[simasima]

とてもわかりやすい説明ありがとうございます！！
まだまだ初心者なので時間がかかりそうですが、御説明を頼りにがんばってみます。