XY座標の点の状態を表現するときの良い方法について

Question

###前提・実現したいこと
XY座標の点の状態を表現するときの良い方法が知りたいです。

例として、右向きにX軸、下向きにY軸が伸びる以下のような
図があるとします。
||||
|::||::||::||::|
|a|b|c|
|d|e|f|

XY座標と対応する位置は以下の通りとなります。
(1, 1) -> a
(2, 1) -> b
(3, 2) -> f

上記のようなデータ構造を表現したいのですが、2次元配列を使うと以下の二つの問題があり、
直観的でなくなってしまいます。
・X Yが配列の添え字では逆になってしまう ※1
・1ではなく0から始まる

※1について

>>> arr = [["a", "b", "c"], ["d", "e", "f"]]
>>> arr[1][0]
'd'

x, y=1, 0のbが取れることを期待しているのに、
結果はdになってしまいます。

X,Y座標ごとの各点の状態を表現するための良い方法はないでしょうか？

###試したこと

苦し紛れに考えたのは以下のようなクラスを作ってそこでデータを保持することです。

class My2DAry(object):
	def __init__(self, ary):
		self._ary = ary

	def get(self, x, y):
		return self._ary[y-1][x-1]

	def set(self, x, y, value):
		self._ary[y-1][x-1] = value

Answer 1

X Yが配列の添え字では逆になってしまう
1ではなく0から始まる

arr = [["a", "d",], ["b", "e"], ["c", "f"]]
print arr[1][0]

第一段階として、並び方を変えます。

arr = [["x", "x", "x"], ["x", "a", "d",], ["x", "b", "e"], ["x", "c", "f"]]
print arr[2][1]

第二段階として、使わない部分に何でもいいですが、
使わない意味の印（x）を入れて位置をずらします。

これで、X, Y = 2, 1 で bが取れます。

ただ、「配列初期化の並びが直感的でない」と感じられるかもしれません。
クラスやメソッドで変換するかどうかは好みしだいですね。
（こちらの方がムダな処理が入らないので、パフォーマンスは微妙にいいですが）

Comments

[evans]

ご回答ありがとうございます。
簡単に解決できるライブラリがあればよかったのですが、そうもいかないみたいですね。
用途に応じて検討してみたいと思います。