[Java]foreach文でNPE

Question

Javaでシミュレーション用のプログラムを書いています．
foreach文でCollectionを回しているのですが，CollectionがnullでないにもかかわらずNullPointerExceptionが発生してしまいます．
以下のソースコードは，colX内の要素を一つ一つ調べ，条件を満たしかつ確率の値がrateより小さいならばcolYに移す，条件を満たさないならばcolXに戻す，それ以外(条件を満たし，確率の値がrate以上)は破棄するというプログラムです．

public static void sampleMethod(Collection<Col> colX, Collection<Col> colY, double rate){
	ArrayList<Col> tempCol = new ArrayList<Col>();
	colY.clear();
	if(colX == null) return;
	for(Col c: colX){ // <<例外発生箇所
		if(c.canDo())
			if(rnd.nextDouble() < rate)colY.add(c);
		else
			tempCol.add(c);
	}
	larvaCicadas.clear();
	larvaCicadas.addAll(tempCicadas);
}

EclipseのDebugで，上の例外発生箇所にブレークポイントを指定してcolXの中身を見てみると，elementDataにはObject[14053]と書いてあり，その中にはmodCountが11002，sizeが9847とありました．
Object[]の値とsizeの値が異なっていますが，自分の中ではこれが原因かと考えています．
ですが，解決方法がわかりません．どのように解決したら良いでしょうか．

###追記2016/8/17 22:05
スタックトレースという言葉が聞きなれなかったので調べてきました．
スタックトレースは多分わかったのですが，本題とは別の問題があるかもしれないことに気づきました．実行するごとにスタックトレースの内容がいちいち変化します．
プログラム中には乱数を用いていますが，プログラムの最初から最後まで乱数のシードは固定してあります．
題の問題とは別の問題が発生しているかもしれないので，この質問を取り下げて新しく質問しなおすべきでしたら新しく質問し直します．

Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException
	at sol.aoki.Cicada.growToAdult(AgentBasedCicadas.java:619)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.Simulating(AgentBasedCicadas.java:371)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.main(AgentBasedCicadas.java:51)

Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.Simulating(AgentBasedCicadas.java:424)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.main(AgentBasedCicadas.java:51)

Exception in thread "main" java.lang.ClassCastException: [I cannot be cast to sol.aoki.Cicada
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.Simulating(AgentBasedCicadas.java:424)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.main(AgentBasedCicadas.java:51)

Exception in thread "main" java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException: 0
	at sol.aoki.Cicada.getGene(AgentBasedCicadas.java:815)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.Simulating(AgentBasedCicadas.java:425)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.main(AgentBasedCicadas.java:51)

Exception in thread "main" java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException: 0
	at sol.aoki.Cicada.getLowerGene(AgentBasedCicadas.java:761)
	at sol.aoki.Cicada.canBeAdult(AgentBasedCicadas.java:749)
	at sol.aoki.Cicada.growToAdult(AgentBasedCicadas.java:620)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.Simulating(AgentBasedCicadas.java:371)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.main(AgentBasedCicadas.java:51)

Exception in thread "main" java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException: 0
	at sol.aoki.Cicada.getGene(AgentBasedCicadas.java:815)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.Simulating(AgentBasedCicadas.java:425)
	at sol.aoki.AgentBasedCicadas.main(AgentBasedCicadas.java:51)

#
# A fatal error has been detected by the Java Runtime Environment:
#
#  SIGSEGV (0xb) at pc=0x00000001055a3791, pid=28582, tid=10499
#
# JRE version: Java(TM) SE Runtime Environment (8.0_45-b14) (build 1.8.0_45-b14)
# Java VM: Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (25.45-b02 mixed mode bsd-amd64 compressed oops)
# Problematic frame:
# V  [libjvm.dylib+0x1a3791]  oopDesc::size()+0x2d
#
# Failed to write core dump. Core dumps have been disabled. To enable core dumping, try "ulimit -c unlimited" before starting Java again
#
# An error report file with more information is saved as:
# /Users/aoki/Documents/workspace/AgentBasedCicadas/hs_err_pid28582.log
#
# If you would like to submit a bug report, please visit:
#   http://bugreport.java.com/bugreport/crash.jsp
#

Comments

[swordone]

原因の箇所は本当にそこで正しいのでしょうか？例外発生時のスタックトレースをすべて掲載して下さい。ちなみにObject[]の値とsizeの値が違うことは全く関係ありません。

[swordone]

スタックトレースを見る限り、ここで提示しているsampleMethodは関係していないようです。AgentBasedCicadasクラスの51行目に問題があるようです。

[退会済みユーザー]

すいませんが，ここのsampleMethodというのはこちらのシミュレーションプログラム中のgrowToAdultというメソッドを変数名，メソッド名を変えて書いてあります(というのも，実験で用いるプログラムなので外部に公開していいものか分からなかったからです)．スタックトレースの上にあるものが呼び出し先のメソッドになるので，やはりこのメソッドに問題があるのではないでしょうか

[swordone]

そのgrowToAdultがないログもありますね…growToAdultがある中では619行目と620行目で問題が発生しているようです。どの行が該当しますか？

[退会済みユーザー]

上記ソースコード上では「例外発生箇所」と書かれた部分が619行目に該当します

Answer 1

スタックトレースがないので正確ではないかも知れませんが、

for(Col c: colX){ // <<例外発生箇所

で取得したcの値が null だった場合は、次のメソッドでNullPointerExceptionが発生しえます。

if(c.canDo())

Answer 2

回答ありがとうございました。
現在扱っているプログラム内で、膨大なオブジェクトを扱っているのですが、そのオブジェクトの数が増えすぎて例外が発生している可能性に気づきました。
そこで、プログラム内でオブジェクトの数が一定数を超えるとシミュレーションを終了するという方法にしたところ、例外が発生しなくなりました。
プログラムの内容を明示的に示さずに質問してすいません。