Atomのプロジェクト内検索（Find in project）で複数文字コードのファイルを対象にしたい

Question

Atomのプロジェクト内検索（Find in project）したときに、UTF-8とshift-jisの文字コードで書かれたファイルを対象にすることは可能でしょうか？。
デフォルトのエンコーディングをshifjisとしても、shitjisでかかれたファイルは検索できません。
ちなみに文字コードの自動反映用のパッケージとしてauto-encordingをインストールしています。