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Matplotlib

MatplotlibはPythonのおよび、NumPy用のグラフ描画ライブラリです。多くの場合、IPythonと連携して使われます。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

pandas

Pandasは、PythonでRにおけるデータフレームに似た型を持たせることができるライブラリです。 行列計算の負担が大幅に軽減されるため、Rで行っていた集計作業をPythonでも比較的簡単に行えます。 データ構造を変更したりデータ分析したりするときにも便利です。

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1回答

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【Python GUI】wxPythonのパネルにseabornで作成したheatmapを表示したい

s_koya

総合スコア25

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MatplotlibはPythonのおよび、NumPy用のグラフ描画ライブラリです。多くの場合、IPythonと連携して使われます。

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Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2021/05/20 10:06

wxPythonを利用したguiで、画面にseabornを使用して作成したヒートマップを表示させたいです。

以下のコードはヒートマップの代わりに関数draw()で取得した振幅図を表示させるものです。

Python

1 import numpy as np 2from numpy import arange, sin, pi 3 4import matplotlib 5matplotlib.use('WXAgg') 6import matplotlib.pyplot as plt 7from matplotlib.backends.backend_wxagg import FigureCanvasWxAgg as FigureCanvas 8from matplotlib.backends.backend_wx import NavigationToolbar2Wx 9from matplotlib.figure import Figure 10 11import pandas as pd 12import seaborn as sns 13 14import wx 15 16class MyFrame(wx.Frame): 17 def __init__(self, parent, id): 18 wx.Frame.__init__(self, parent, id, u"heatmap_test",size=(400,300)) 19 self.panel = wx.Panel(self, id, size=(900, 700)) 20 self.figure = Figure() 21 self.axes = self.figure.add_subplot(111) 22 self.draw() 23 self.canvas = FigureCanvas(self.panel, wx.ID_ANY, self.figure) 24 self.sizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL) 25 self.sizer.Add(self.canvas, 1, wx.LEFT | wx.TOP | wx.GROW) 26 self.SetSizer(self.sizer) 27 self.Fit() 28 29 # ヒートマップの代わりにpltを表示している 30 def draw(self): 31 t = arange(0.0, 3.0, 0.01) 32 s = sin(2 * pi * t) 33 self.axes.plot(t, s) 34 35 36 # 画面に表示したいヒートマップ 37 def heatmap(self): 38 np.random.seed(2018) 39 40 plt.style.use('default') 41 sns.set() 42 sns.set_style('whitegrid') 43 44 # make 10x6 matrix 45 data = np.random.binomial(100, 0.05, 60).reshape((10, 6)) 46 data = np.log2(data + 1) 47 48 df = pd.DataFrame(data, 49 index=['gene ' + str(i + 1) for i in range(10)], 50 columns=['A', 'B', 'C', 'D', 'E', 'F']) 51 52 sns.heatmap(df, square=True) 53 54 55class MyApp(wx.App): 56 def OnInit(self): 57 self.frame = MyFrame(parent=None, id=-1) 58 self.SetTopWindow(self.frame) 59 self.frame.Show() 60 return True 61 62 63if __name__ == "__main__": 64 app = MyApp(0) 65 app.MainLoop()

本来はheatmap()関数で作成したヒートマップを振幅図を表示しているパネルに表示させたいです。
よろしくお願いいたします

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guest

回答1

0

自己解決

ヒートマップを生成する関数に、引数でAxesSubplotを渡すことで解決しました。
sns.heatmap(df, square=True, ax=self.axes)

投稿2021/05/21 02:41

s_koya

総合スコア25

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