ubuntuのアップデートに伴い、プログラムが実行できなくなりました。

Question

#問題の詳細
ubuntuを20にアップデートしたところ、今まで実行できていたプログラムに対して
エラーメセージが出るようになってしまいました。
エラーメッセージにあるbomb DOS attack.までは以前も出ていましたが
問題なく実行できていました。

原因がわからないため教えていただきたいです。

#発生している問題・エラーメッセージ

/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/Image.py:2763: DecompressionBombWarning: Image size (120560400 pixels) exceeds limit of 89478485 pixels, could be decompression bomb DOS attack.
  warnings.warn(
Traceback (most recent call last):
  File "p.py", line 21, in <module>
    plt.imshow(im_list, cmap="jet")
  File "/usr/local/lib/python3.8/dist-packages/matplotlib/pyplot.py", line 2724, in imshow
    __ret = gca().imshow(
  File "/usr/local/lib/python3.8/dist-packages/matplotlib/__init__.py", line 1447, in inner
    return func(ax, *map(sanitize_sequence, args), **kwargs)
  File "/usr/local/lib/python3.8/dist-packages/matplotlib/axes/_axes.py", line 5523, in imshow
    im.set_data(X)
  File "/usr/local/lib/python3.8/dist-packages/matplotlib/image.py", line 702, in set_data
    raise TypeError("Image data of dtype {} cannot be converted to "
TypeError: Image data of dtype object cannot be converted to float

#該当のソースコード

import os
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from PIL import Image

#画像pass
path_b4 = ('S2B_MSIL2A_20201202T020039_N0214_R060_T53SLV_20201202T041853.SAFE/GRANULE/L2A_T53SLV_A019534_20201202T020037/IMG_DATA/R10m/T53SLV_20201202T020039_B04_10m.jp2')


#画像の読み込み
im = Image.open(path_b4)

#画像をarrayに変換
im_list = np.array(im)


#コンター図作成
plt.imshow(im_list, cmap="jet")
plt.colorbar () 
plt.xlabel('X')
plt.ylabel('Y')
plt.show()

#試したこと
コンター図作成前に
print(type(im_list))
print(im_list.shape)
を行ったところ以下のような結果が得られました。

<class 'numpy.ndarray'>
()

何故か配列の要素数が得られませんでした。
これはアップデート前は表示できていました。
#補足情報
ubuntu18からubuntu20にアップデートを行いました。
画像はjp2を用いており、(10980, 10980)の大きさです。

また余談ですが、添付画像のようにububtu端末の＄の左側にカレントディレクトリが
表示されないようになっており困っています。
設定の仕方等ご存知の方は教えていただけると幸いです。

Comments

[jbpb0]

エラーメッセージの1行目は、
/usr/lib/python3/dist-packages/...
ですが、他は
File "/usr/local/lib/python3.8/dist-packages/...
です
dist-packagesが2ヵ所にありますが、それは大丈夫ですか？

もしかしたら、Pythonが2種類入ってて、呼び出されているモジュールが混ざっているとか

Answer 1

二つ問題があるようです。

1 図が描画されない問題

TypeError: Image data of dtype object cannot be converted to float

こちらの記事が参考になるかと思われます。
↓
TypeError：画像データはフロートに変換できません

2 画像サイズが限界値超えているためDOS攻撃かもしれないという警告

DecompressionBombWarning: Image size (120560400 pixels) exceeds limit of 89478485 pixels, could be decompression bomb DOS attack.

こちらの記事が参考になるかと思われます。
↓
Pillowで扱える最大ピクセル数を増やす

Comments

[assemble]

教えていただいたことを反映し、以下のようなプログラムを作成しました。

-----------------------------------------------python3
import os
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from PIL import Image

#扱える最大ピクセル数を増やす
Image.MAX_IMAGE_PIXELS = 200000000

#画像pass
path_b4 = ('S2B_MSIL2A_20201202T020039_N0214_R060_T53SLV_20201202T041853.SAFE/GRANULE/L2A_T53SLV_A019534_20201202T020037/IMG_DATA/R10m/T53SLV_20201202T020039_B04_10m.jp2')

#画像の読み込み
im = Image.open(path_b4)

#画像をarrayに変換
im_list = np.array(im)
im_list_float = im_list.astype(np.float32)

#コンター図作成
plt.imshow(im_list, cmap="jet")
plt.colorbar ()
plt.xlabel('X')
plt.ylabel('Y')
plt.show()
-----------------------------------------------

しかし以下のようなエラーが発生しました。

-----------------------------------------------エラーコード
Traceback (most recent call last):
File "p.py", line 27, in <module>
im_list_float = im_list.astype(np.float32)
TypeError: float() argument must be a string or a number, not 'Jpeg2KImageFile'
-----------------------------------------------

これはjp2画像が扱えないということでしょうか？
pngファイルを用いたときは画像を表示することができました。

[_whitecat_22]

im_list_float = im_list.astype(np.float32)
↑
この行で型エラーを起こしています。

以下の記事が参考になるかと思われます。

Prophet の `TypeError: float() argument must be a string or a number` は `plot` の前に `pd.plotting.register_matplotlib_converters()` を追加すると解決する(https://qiita.com/c67e708d/items/27f222b129eb168e2b65)

[assemble]

試したのですがエラー文に変化がありませんでした。

[_whitecat_22]

あいにく、これ以上のこととなると、ubuntuを利用していないこともあり、私も分かりませぬ。
申し訳ございません。

[assemble]

いえ、丁寧に対応していただきありがとうございました。
参考に頑張ってみます。