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Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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JupiterNotebookでThe kernel appears to have died. It will restart automatically.と表示された時の対処法

SoccerBooks

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Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2020/10/19 00:38

編集2020/10/19 03:09

前提・実現したいこと

JupiterNotebookにおいて、以下のようなプログラムを実行したところ、
Kernel Restarting
The kernel appears to have died. It will restart automatically.
といった表示が出てしまい、プログラムを実行することができません。

もしわかる方がいれば、教えていただきたいです。

発生している問題・エラーメッセージ

Kernel Restarting The kernel appears to have died. It will restart automatically.

該当のソースコード

Python

1import numpy as np 2from sklearn.linear_model import LogisticRegression 3 4ar2_data = np.loadtxt(fname = "spamdata1000.csv", delimiter = ",") 5array_y = ar2_data[:, 0] 6ar2_X = ar2_data[:, 1:] 7 8lrg = LogisticRegression(solver = 'lbfgs', multi_class = 'auto', max_iter=1000) 9lrg.fit(ar2_X, array_y) 10 11print(lrg.score(ar2_X, array_y))

試したこと

インターネットで検索したところ、numpyをアップデートする方法や、dockerでメモリを増やすことも書かれていて、いくつか試してみましたが、うまくいきませんでした。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

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bsdfan

2020/10/19 12:20

メモリ不足が一番疑わしいです。 csvの行数、ファイルサイズはどれぐらいですか? それと、環境(OS, Docker?)とメモリ、スワップの量は?
SoccerBooks

2020/10/23 03:30

返信が遅くなり申し訳ありません。 csvの行数;1000 ファイルサイズ;149kb OS;Catalina(MacBookpro) Docker; CPUs;3 memory;8.00GB Swap;2GB となっています。
bsdfan

2020/10/23 10:01

それぐらいのファイルだと、メモリ不足ではなさそうですね。 プログラムを一行ずつ実行して、何をしたときにkernelが止まるかを見てみると、原因がわかるかもしれません。
SoccerBooks

2020/10/23 10:49

ご返信ありがとうございます。 ご指摘の通り、1行ずつプログラムを実行してみたところ、fit関数を実行した際にエラーが出てきました。 実は、以前このエラーが出た時、numpyをアップデートすることで解決したのですが、今回はどうにもなりませんでした・・・
bsdfan

2020/10/23 13:08

原因わからないですね。 fitで落ちるというのが、stackoverflowでもgithubでも見つかりますが、対処方法もまちまちです。 多くはnumpyやsklearnのアップデートや再インストールみたいですね。anacondaならnomklを入れてみるとか。
SoccerBooks

2020/10/23 23:32

仰る通り、numpy,scikit-learnのupdateおよび、ターミナルでconda update numpy mklとすることで直りました! いろいろと教えてくださり本当にありがとうございます。
guest

回答1

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自己解決

numpyのupdate,scikit-leranのupdate,ターミナルでconda update numpy mklとすることで解決

投稿2020/10/23 23:33

SoccerBooks

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