JupiterNotebookでThe kernel appears to have died. It will restart automatically.と表示された時の対処法
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前提・実現したいこと
JupiterNotebookにおいて、以下のようなプログラムを実行したところ、
Kernel Restarting
The kernel appears to have died. It will restart automatically.
といった表示が出てしまい、プログラムを実行することができません。
もしわかる方がいれば、教えていただきたいです。
発生している問題・エラーメッセージ
Kernel Restarting
The kernel appears to have died. It will restart automatically.該当のソースコード
import numpy as np
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
ar2_data = np.loadtxt(fname = "spamdata1000.csv", delimiter = ",")
array_y = ar2_data[:, 0]
ar2_X = ar2_data[:, 1:]
lrg = LogisticRegression(solver = 'lbfgs', multi_class = 'auto', max_iter=1000)
lrg.fit(ar2_X, array_y)
print(lrg.score(ar2_X, array_y))試したこと
インターネットで検索したところ、numpyをアップデートする方法や、dockerでメモリを増やすことも書かれていて、いくつか試してみましたが、うまくいきませんでした。
補足情報（FW/ツールのバージョンなど）
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numpyのupdate,scikit-leranのupdate,ターミナルでconda update numpy mklとすることで解決
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bsdfan
2020/10/19 21:20
メモリ不足が一番疑わしいです。
csvの行数、ファイルサイズはどれぐらいですか？
それと、環境(OS, Docker?)とメモリ、スワップの量は？
SoccerBooks
2020/10/23 12:30
返信が遅くなり申し訳ありません。
csvの行数；１０００
ファイルサイズ；１４９kb
OS；Catalina(MacBookpro)
Docker；
CPUs;3
memory;8.00GB
Swap;2GB
となっています。
bsdfan
2020/10/23 19:01
それぐらいのファイルだと、メモリ不足ではなさそうですね。
プログラムを一行ずつ実行して、何をしたときにkernelが止まるかを見てみると、原因がわかるかもしれません。
SoccerBooks
2020/10/23 19:49
ご返信ありがとうございます。
ご指摘の通り、１行ずつプログラムを実行してみたところ、fit関数を実行した際にエラーが出てきました。
実は、以前このエラーが出た時、numpyをアップデートすることで解決したのですが、今回はどうにもなりませんでした・・・
bsdfan
2020/10/23 22:08
原因わからないですね。
fitで落ちるというのが、stackoverflowでもgithubでも見つかりますが、対処方法もまちまちです。
多くはnumpyやsklearnのアップデートや再インストールみたいですね。anacondaならnomklを入れてみるとか。
SoccerBooks
2020/10/24 08:32
仰る通り、numpy,scikit-learnのupdateおよび、ターミナルでconda update numpy mklとすることで直りました！
いろいろと教えてくださり本当にありがとうございます。