Python matplotlibアニメーションでの背景図形のズレについて

Question

前提・実現したいこと

Pythonのmatplotlibで粒子軌道のアニメーションを作っています．

元のtxtデータがこれで，

gifのイメージが

こんな感じです．

何が問題かというと私は「(x,y)=(0,0)を中心とする半径1.8の円を底面として高さが-1.8<z<1.8の円柱」を背景に入れたいのですが，なぜかxy平面がズレてしまいます．
アニメーションの文字と被らないように勝手に文字を入れたのが原因でしょうか？

またこれをあるべき位置に移動させるにはどのようにするべきか対処法を教えてほしいです．

参考1，アニメーションについて
2，円柱描画

テキストパース部分

import re
%matplotlib inline
import numpy as np

from matplotlib import pyplot as plt
from matplotlib.animation import FuncAnimation
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import mpl_toolkits.mplot3d.art3d as art3d
from matplotlib.patches import Circle

with open("rev2.txt") as f:
    lines = f.read().splitlines()

sep_indices = []
for i, line in enumerate(lines):
    if line.startswith("t"):
        sep_indices.append(i)

data = []
for s, e in zip(sep_indices, sep_indices[1:] + [len(lines)]):
    time_str = lines[s]
    points_str = "\n".join(lines[s + 1 : e])

    time = float(re.match(r"t=(.+)ns", time_str).group(1))
    w, x, y, z = np.fromstring(points_str, sep=" ").reshape(-1, 4).T
    color = np.where(w == 0, "r", "w")  # 1列目が0なら赤、それ以外なら白

    data.append({"time": time, "color": color, "x": x, "y": y, "z": z})

アニメーション作成部分

fig = plt.figure(figsize=(9, 9))
ax = fig.add_subplot(projection="3d")


zzz = np.linspace(-1.8, 1.8, 100)
theta = np.linspace(0, 2*np.pi, 100)
Theta,backz=np.meshgrid(theta, zzz)
backx = 1.8*np.cos(Theta)
backy = 1.8*np.sin(Theta)

ax.plot_surface(backx,backy,backz, color='#f8ecd5',alpha=0.2)

soko = Circle((0, 0), 1.8,color='#f8ecd5',alpha=0.2)
ax.add_patch(soko)
art3d.pathpatch_2d_to_3d(soko, z=-1.8, zdir="z")

futa = Circle((0, 0), 1.8,color='#f8ecd5',alpha=0.2)
ax.add_patch(futa)
art3d.pathpatch_2d_to_3d(futa, z=1.8, zdir="z")




ax.set_xlabel('x axis')
ax.set_ylabel('y axis')
ax.set_zlabel('z axis')
ax.set_xlim([-2.5, 2.5])
ax.set_ylim([-2.5, 2.5])
ax.set_zlim([-2.5, 2.5])


# 空の散布図とタイトルオブジェクトを作成しておく。
scatter = ax.scatter([], [], [], c="b")
title = ax.set_title("")
  

def update(sample):
    # タイトル更新を更新する。
    title.set_text(f"time={sample['time']}ns")
    # 散布図更新を更新する。
    scatter._offsets3d = (
        sample["x"],
        sample["y"],
        sample["z"],
    )
    # 点とエッジの色を更新する。
    scatter._facecolor3d = sample["color"]
    scatter._edgecolor3d = sample["color"]

# アニメーションを作成する。
anim = FuncAnimation(fig, update, data, interval=100)
anim.save("rev2.gif", writer="pillow")

このzzzやbackxが自分で勝手に入れた文字ですがそのままx,y,zと入れていくとアニメーション部分にぶつかりそうな気がしたり，ほかの部分の文字を変えていくと結局同じような問題が発生しそうで混乱してしまいました．
調べれば調べるほどわからなくなってきたので教えていただけますと幸いです．

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

Pythonとanacondaは本日アップデートしたばかりです．

Answer 1

図形がずれているのではなく、目盛りがずれています。
以下を消すと直ります。

- ax.set_xlim([-2.5, 2.5])
- ax.set_ylim([-2.5, 2.5])
- ax.set_zlim([-2.5, 2.5])

matplotlib の 3D グラフ描画機能は OpenGL のように本当の意味での 3D レンダリングを行っているわけではないので、3D 描画に関しては所々問題があるようです。

Comments

[Kinsho]

できました！
昨日のアニメーションに続きご回答ありがとうございます．
この課題が終わったらグラフ描画ツールについて勉強して私も使いこなせるように頑張りたいと思います！