Let's Encryptを使ってSSL証明書を発行したい

現在、AWSでサーバーを建てて、公開予定のwebサイトにSSL証明証を発行しようと思い
certbotをインストールし、証明書発行を行おうとしたところ、失敗してしまい、証明書を発行することができませんでした。
その時の実行したコマンドと、エラーメッセージが以下になります

certbot-auto certonly --webroot -w /var/www/html -d hoge.com --email hoge@hoge.com --no-self-upgrade --debug

Traceback (most recent call last):
  File "/usr/bin/virtualenv", line 6, in <module>
    from pkg_resources import load_entry_point
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/pkg_resources/__init__.py", line 3049, in <module>
    @_call_aside
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/pkg_resources/__init__.py", line 3033, in _call_aside
    f(*args, **kwargs)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/pkg_resources/__init__.py", line 3062, in _initialize_master_working_set
    working_set = WorkingSet._build_master()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/pkg_resources/__init__.py", line 660, in _build_master
    return cls._build_from_requirements(__requires__)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/pkg_resources/__init__.py", line 673, in _build_from_requirements
    dists = ws.resolve(reqs, Environment())
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/pkg_resources/__init__.py", line 858, in resolve
    raise DistributionNotFound(req, requirers)
pkg_resources.DistributionNotFound: The 'virtualenv==15.1.0' distribution was not found and is required by the application

サーバーは　Amazon Linux です。
よろしくお願いします。