body内のみ編集可能なCMSでスクロールに合わせた要素のフェードインアニメーション実装したい

コムログクラウドというCMSを使用しサイトを制作しているのですが、スクロールに合わせて要素がフェードインするアニメーションを実装したいと考えています。
しかし、仕様上用意されたデザインテンプレートの中からのカスタマイズしかできず、CSSやJSの読み込みができないためアニメーションの実装が難航しています。

唯一、HTMLの<body>内のソースコードのみ書き込み可能です。

今までCMSのテンプレートのみを使ってWEBサイトを制作していたため、HTMLとCSSの簡単な編集経験しかなく、javascriptについての知識がほとんどありません。

自分で調べることができた範囲では、HTML内にCSSやscriptタグを直で書き込む方法を見つけたのですが、どれも<head>内にjQuery読み込むことが前提になっていて、<body>内だけの編集で可能なのか、可能であればどのような方法があるかがわからない状態です。

コーディングについての知識が乏しく、初歩的な質問で恐縮ですが以下①、②についてご回答いただけると幸いです。

①HTMLのbody内の編集のみでスクロールに合わせた要素のフェードインアニメーションを実装することは可能でしょうか。
②可能な場合どのような方法で実装すればよろしいでしょうか。

よろしくお願いいたします。