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Matplotlib

MatplotlibはPythonのおよび、NumPy用のグラフ描画ライブラリです。多くの場合、IPythonと連携して使われます。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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matplotlibにクラスタリングの結果を残したまま個体番号を表示させたい

wabi_4

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投稿2020/07/16 06:25

編集2020/07/16 06:28

python

1 2```### 前提・実現したいこと 3クラスタリングの結果を残したまま、主成分分析でデータの個体番号を一緒に表示させる書き方が分かりません。 4### 該当のソースコード 5 6```python 7def main(data,eps,min_samples): 8  db = DBSCAN(eps=eps, min_samples=min_samples) 9  db.fit(data) 10  labels = db.labels_ 11  unique_labels =set(np.unique(labels)) 12  colors = plt.cm.Spectral(np.linspace(0, 1, len(unique_label))) 13 14  pca = PCA(n_components=2) 15  pca.fit(data) 16  data_pca = pca.transform(data) 17   for k, color in zip(unique_labels, colors): 18 if k == -1: 19 color = 'k' 20 class_member_mask = (labels == k) 21 xy = data_pca[class_member_mask] 22 plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1],'o', markerfacecolor=color, markeredgecolor='k', markersize=7)

イメージとしては、このような感じに表示させたいです。

試したこと

個体番号のみを表示させることはできますが、クラスタリングの結果を残したまま、表示させることができません。

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回答1

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ベストアンサー

違う趣旨(文字化けしてしまう)でしたがTeratailに似たQAがありました
python Matplotlibでグラフを表示させた際にラベルが表示されない

違うやりかたもあるかもしれませんがとりあえずこんな風で出力できると思います。

Python

1 2for i in range(len(labels)): 3 plt.annotate(labels[i], 4 xy=(xy[i, 0], xy[i, 1]), 5 xytext=(0,0), 6 textcoords='offset points' 7 )

投稿2020/07/16 08:52

aokikenichi

総合スコア2218

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wabi_4

2020/07/16 09:47

このコード通りにしてみましたが、以下のようなエラーが出ました。 index 5 is out of bounds for axis 0 with size 5 for k, color~の文を書き換える必要があるかもしれません。しかし、どのように書き換えればいいか分かりません。
aokikenichi

2020/07/16 09:51

表示したい文字はどの変数に入っているのでしょうか それを指定すればよいと思います
wabi_4

2020/07/16 10:17

ありがとうございます。 xyをdata_pcaに変え、表示したい変数に変えたらできました。
aokikenichi

2020/07/16 10:57

すみませんコードチェックが甘く失礼いたしました
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