Pythonによるファイルの基礎的な処理 助けてください！

Question

前提・実現したいこと

普段は生物系の勉強をしておりプログラミングは始めたばかりの初心者中の初心者です。プログラミング用語などもほとんどわかりません。必要があり、次のような内容のファイルをPythonを使って処理しています。
＃から始まるタイトル行と、それに続く大小文字のABCDの羅列をワンセットにして、それを繰り返しているだけのファイルです。
以下に書いているのは例であり、実際のファイルの内容とは異なります。
(ファイル例)

#1-9876543

AcddDCBACDcA....

#2-1234567

CbCbDaDDDb.....

#3

.....

この、それぞれの配列について、ABCDの数を大文字小文字を区別せず以下のようにカウントして出力したいのですが、どうしたらよいでしょうか。

(出力の目標例)

#1-9876543 A:20　B:31 C:4 D:7
#2-1234567 A:1 B:23 C:45 D:80

.....

発生している問題・エラーメッセージ

[1]
A:16
a:4
B:17
b:14
C:2
c:2
D:1
d:6
[2]
A:1
a:0
T:21
t:2
C:43
c:2
G:40
g:40
.....
というような出力が帰ってきます。
目標の出力のように、１、改行なしにする.２、タイトル行をそのまま出力したい.（[1]の代わりに[#1-9876543]）３、大文字と小文字を区別せずまとめ、A,B,C,Dの四つについて数えたい.という三つの要望があります。

該当のソースコード

file = open("ファイル名").read()
lines = file.split('\n')
from collections import Counter
counts = []
last = Counter()
for line in lines:
    if line.startswith('#'):
        if last:
            counts.append(last)
            last = Counter()
    else:
         last = last + Counter(line)
counts.append(last)
for line, count in enumerate(counts):
    print([line])
    for alphabet in ('A', 'a', 'B', 'b', 'C', 'c', 'D', 'd'):
        print(" {}: {}".format(alphabet, count[alphabet]))

試したこと

ネットで探したコードを試行錯誤してる状態で、上のコードも完全に理解してるとは言えないです。

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

丸三日ほどインターネット中を探しましたが、初心者にはほとんど理解できないものばかりでした。非常に難儀しています。どうかよろしくお願い致します。

Comments

[can110]

インデントがなくなりコードが読めないので、ソースコードはコードブロックで囲んでください。
以下↓手順動画
https://teratail.storage.googleapis.com/uploads/contributed_images/56957fe805d9d7befa7dba6a98676d2b.gif

[unagiusagi]

完了しました。ご指摘ありがとうございます。

[meg_]

「丸三日ほどインターネット中を探しましたが、初心者にはほとんど理解できないものばかりでした」とのことですが、どのサイトを見ましたか？ どのサイトが理解出来ませんでしたか？（質問者さんの理解度を知るための質問です）

[unagiusagi]

元々は生物関係のファイル（fasta file）なので、英語のウェブサイトで同様の処理をしている質問を直接探しました。pythonは基礎の授業で数週間触れたくらいです。基本的な処理はネットで逐一探しながら行なっているような状況です。

[aokikenichi]

元バイオインフォマティシャンです。
fastaですよね
例示されているものもそうですが
#はじまりではなく
>はじまりですよね

line.startswith('#'):
では動かないと思いますが

[unagiusagi]

コメントありがとうございます。
すみません、より回答が集まるようにということで問題を一般化して形式だけ変えて載せたつもりでした。
元の形式で質問し直したほうがいいでしょうか。

[meg_]

Python（による処理）を解説しているサイトを見たというわけではないということでしょうか？
「３、大文字と小文字を区別せずまとめ」については、「Python　大文字　小文字」などでネット検索すれば判定方法等見つかりますので調べましょう。質問者さんのやりたいことを全てまとめて解説している情報を見つけることは難しいので、処理の一つ一つを個別に調べるのがより良い方法だと思います。

[unagiusagi]

コメントありがとうございます。色々と調べているのですが、応用が全くできないもので具体的なコードをかけないでいます。引き続き頑張ってみます。

[otn]

そもそも、Python入門は終えていますか？それとも入門せず、ググってコピペですか？

Answer 1

ファイルの基礎的な処理 助けてください！

とうことですが、ファイルの処理はほぼちゃんと書けています。
ファイルから読んだ後の処理が意味不明です。変数の意味も理解できない。

見出し行とデータ行が交互にあるなら、こんな感じで。

from collections import Counter
for line in open("～～～"):
    line = line.strip()
    if line.startswith('>#'):
        print(line,end=" ")
    else:
        # Counter表示そのままでいいなら
        print(Counter(line.upper()))
        # 文字でソートするなら
        print(dict(sorted((Counter(line.upper())).items())))

Answer 2

追記修正依頼にも書きましたが「＃から始まるタイトル行」と説明文にあるのに例示されているファイルは「>」でプログラム例では「#」を扱おうとしてます。
fasta形式なら > 、あえて # になさりたいならファイル例も # 始まりとした方が分かりやすいかと

私だったらこうします
Counterを使ってもいいですけどもし、Aが一つもない時にA:0と出なくなるので（まれですけどあり得ますよね）
他の方もご指摘してますが文字列を大文字か小文字に統一すればよろしいかと。

ABCDではなくACGTとしました。

for line in open("ファイル名"):
  line = line.strip()
  if line.startswith('>'):
    header = line[1:]
  else:
    line = line.upper()
    print(header, 'A:{} C:{} G:{} T:{}'.format(line.count('A'), line.count('C'), line.count('G'), line.count('T')))

これでご要望通り下記のような出力となります

#hoge A:2 C:2 G:2 T:2
#hoge2 A:2 C:3 G:6 T:2

また補足ですが、提示されている出力例でA:20 B:31の間だけ空白２文字ですけどこれ意味ないですよね。こういうのも揃えておいた方がよいです。回答側では分からないので。

#1-9876543 A:20　B:31 C:4 D:7
#2-1234567 A:1 B:23 C:45 D:80

Answer 3

１、改行なしにする

print('hoge', end = 'fuga')のようにend引数を指定することによって、改行以外の任意の文字列を改行のかわりに出力できます。

Answer 4

３、大文字と小文字を区別せずまとめ、A,B,C,Dの四つについて数えたい
について回答します。

文字列を大文字か小文字に統一してからカウントすれば良いです。
下記は簡単な例です。

s = "AcddDCBACDcA"
s = s.upper()
print(s)
'ACDDDCBACDCA'

Pythonで大文字・小文字を操作する文字列メソッド一覧