自分的にはサーバーを3つ(Webサーバー、APサーバー、DBサーバー)用意して、
Webサーバーでアプリケーション層のみを実装したWebアプリケーションを稼働させ、ApサーバーでWebApiを稼働させ、
DBサーバーでDBを稼働させるが正しいと思うのですが、どうでしょう？
追記
下記のサイトを見て、Web3層構造の場合はクライアントからのリクエストへのレスポンスをWebサーバーが担い、動的処理はAPサーバーが担い、DBが稼働するのがDBサーバーだと思いました。
クライアント→Webサーバー→APサーバー→DBサーバー
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ソフトウェアのアーキテクチャがレイヤードアーキテクチャ場合、アプリケーション層がクライアントからのリクエストへレスポンスするのでアプリケーション層のみを実装したWebアプリケーションを稼働させ、WebApiがAPサーバーで稼働していればDBサーバーへのアクセスと動的処理が可能だと思いました。それが正しいと思う根拠です。
それ以外が間違っていると思う根拠はありません。
https://hnavi.co.jp/knowledge/blog/web-application-server/
http://nari104.hatenablog.jp/entry/2016/06/05/000004
https://thinkit.co.jp/article/11837
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「なにが正しいか」はアプリケーションによるし、事情にもよるでしょう。別に全て同じサーバー内にあったとて「間違いである」と全て否定できる材料もないです。
それより質問の意図が不明です。「どうでしょう？」これは質問ですか？アンケート(非推奨)ですか？
三層云々よりそちらが先です。
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2020/06/14 21:10
複数のユーザーから「問題・課題が含まれていない質問」という意見がありました
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「編集」ボタンから編集を行い、質問の意図や解決したい課題を明確に記述していただくと回答が得られやすくなります。
javahack
2020/06/16 02:00
物理的な意味で「サーバーを3つ」必要と考えているのであれば、既に指摘があるように規模や要件次第ということになります。
小規模のWebアプリケーションでは1台のハードウェアに3つの機能を担うアプリケーションを搭載することもあります。
yuki1111
2020/06/18 00:01
なるほど、ありがとうございます。