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ディレクトリの名前をディレクトリの中のファイルに貼り付ける方法

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iziz

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カレントディレクトリに7つのディレクトリがあり、各ディレクトリにtsvファイルが格納されています。
すべてのtsvファイルは同じ名前がついています。

$ $ ls */*.tsv
SRR1550989/abundance.tsv  SRR1551005/abundance.tsv  SRR1551011/abundance.tsv  SRR1551050/abundance.tsv  SRR1551057/abundance.tsv  SRR1551071/abundance.tsv  SRR1551091/abundance.tsv


各tsvファイルの名前の先頭に各ディレクトリの名前を追加する作業をbash上で行いたいのですが、方法を教えて頂けないでしょうか。

下記の様に、ディレクトリの名前と無関係な連番をつける方法は分かるのですが、

ls */*.tsv | awk '{ printf "mv %s test%03d.png\n", $0, NR }'
mv SRR1550989/abundance.tsv test001.png
mv SRR1551005/abundance.tsv test002.png
mv SRR1551011/abundance.tsv test003.png
mv SRR1551050/abundance.tsv test004.png
mv SRR1551057/abundance.tsv test005.png
mv SRR1551071/abundance.tsv test006.png
mv SRR1551091/abundance.tsv test007.png

入力値を使ってファイル名を変更する方法が知りたいです。
readコマンドとパイプを使ってなんとかできるのではと思っているのですが、、、、

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  • hotta

    2020/04/24 23:24

    やりたいことが今ひとつ見えません。
    SRR1550989/abundance.tsv として見えているファイル名を
    SRR1550989/SRR1550989_abundance.tsv などにしたいということですか?

    キャンセル

  • iziz

    2020/04/25 00:40

    言葉足らずですみません。
    ご理解のとおりです。

    キャンセル

回答 2

0

readコマンドとパイプを使ってなんとかできるのではと思っているのですが、、、、

もうちょっとコンパクトに書く方法はありますが、見てわかりやすいのはこんな感じで。

ls */*.tsv | while read name
  dir=`dirname $name`
  file=`basename $name`
  mv $name $dir/$dir-$file
done

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  • 2020/04/25 00:39 編集

    早速ありがとうございます。
    頂いた回答、whileの後にdoを足すとちゃんと動作しました。

    dirname、basenameというコマンドでディレクトリ名とファイル名を取得できるんですね。
    勉強になりました。
    ちなみにもっとコンパクトに書くとどんな感じになるのでしょうか?

    キャンセル

  • 2020/04/25 01:28 編集

    あ、do忘れてました。

    for name in */*.tsv
    do mv $name ${name%/*}/${name%/*}-${name##*/}
    done

    ${~~} の中の意味はman bashに書いてあります。

    キャンセル

  • 2020/04/25 23:04 編集

    いつもありがとうございます。こちらも調べておきます

    キャンセル

0

ファイル名が固定なら、以下のでよろしいのでは。

for a in ~/*; do \
 [ -d $a ] && [ -f $a/abundance.tsv ] && mv $a/abundance.tsv $a/${a}_abundance.tsv \
 done

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  • 2020/04/26 00:22 編集

    ありがとうございます。エラーは出ないのですが、ファイル名が変更されないのですが、何がおかしいのでしょうか。

    キャンセル

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