pymcがインポートできない件

Question

お疲れ様です。

▼やりたいこと
・pythonを使ってベイズ推定を行いたいため、pymcをインポートしたい

▼発生している事象
・pymc3はインポートできるが、pymcがインポートできない。

▼行なっていること
macのターミナルで以下を実行しています。

pip install pymc

その結果、以下のエラーが返ってきます。

Collecting pymc
Using cached pymc-2.3.6.tar.gz (348 kB)
Building wheels for collected packages: pymc
Building wheel for pymc (setup.py) ... error
ERROR: Command errored out with exit status 1:
command: /Users/shyada/anaconda3/bin/python -u -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'

次に、色々調べると、

pip install pymc してしまうとPyMC 2.3がインストールされてしまう

という書き込みを見たので、同じくターミナルで以下を実行すると、

pip install git+https://github.com/pymc-devs/pymc

やはり、エラーが返ってきます。

Collecting git+https://github.com/pymc-devs/pymc
Cloning https://github.com/pymc-devs/pymc to /private/var/folders/zz/1ywkjyw55232vjbkf7zzmgtjzw7vk_/T/pip-req-build-r_96_6wt
Running command git clone -q https://github.com/pymc-devs/pymc /private/var/folders/zz/1ywkjyw55232vjbkf7zzmgtjzw7vk_/T/pip-req-build-r_96_6wt
Building wheels for collected packages: pymc
Building wheel for pymc (setup.py) ... error
ERROR: Command errored out with exit status 1:
command: /Users/shyada/anaconda3/bin/python -u -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'

これは、解決の方法はありますでしょうか？

Answer 1

私はpystan派なので、詳しいことを言えませんが、pymcはpython2系、pymc3はpython3系らしいのでこれが影響しているかもしれません。
おそらく、pymc3はpymcの後継なので、pymc3がインストール済みであれば、問題ないような気がします。ただし、関数の名称や仕様は変更されているでしょうから、既存のプログラムを変更なしで動かすことはできないことが問題になりますが、質問を見るかぎりこれから取りかかるようなので、pymc3に絞って使い方を覚えてはいかがでしょうか。

Comments

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有難うございます。
pymc3で検討してみます。