Rで read.csv が失敗する
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RStudio Version 1.0.153 で以下のようにファイルを読み込もうとするのですが警告が出ます。
> x <- read.csv("C:\\Users\\username\\Desktop\\Data\\samples.csv", header=T, fileEncoding="utf-8")
Warning messages:
1: In read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, :
invalid input found on input connection 'C:\Users\username\Desktop\Data\samples.csv'
2: In read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, :
incomplete final line found by readTableHeader on 'C:\Users\username\Desktop\Data\samples.csv'
警告だけなので、中身を見てみようとすると、読み込みに失敗しているようです。
> x
[1] X.
<0 行> (または長さ 0 の row.names)
ファイルの中身は以下のような感じでカンマ区切りのcsvファイルになっています（実際には302行499列あります）。
エクセルで開いてみましたが、行や列がずれているわけではないようです。
ID,i1/j1/k1,i2/j1/k1,i1/j2/k1,i1/j1/k2,i2/j2/k1,i2/j1/k2,i1/j2/k2,i2/j2/k2
sample1,0,0,0,0,1,0,0,1
sample2,0,0,0,0,1,0,0,0
sample3,1,1,0,0,0,0,0,0
sample4,0,0,0,0,0,0,0,1
sample5,0,0,1,0,0,0,1,0
sample6,0,0,0,1,0,0,0,0またエラーメッセージで検索して以下のことを試しましたが、いずれも失敗に終わりました。
csvファイルの最終行に（すでに有りましたが）改行を追加 -> 変わらず同じ警告が出る
エンコードをutf-8-BOMと指定する -> 以下のようなエラーが出る
> x <- read.csv("C:\\Users\\username\\Desktop\\Data\\samples.csv", header=T, fileEncoding="utf-8-BOM")
Error in file(file, "rt", encoding = fileEncoding) :
unsupported conversion from 'utf-8-BOM' to ''どの様に修正すれば正しく読み込めるでしょうか？宜しくお願いいたします。
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checkベストアンサー
0
掲出されたデータを試してみましたが、状況を再現できませんでした。
次のことを試してみてはどうでしょう。
- fileEncodingをつけずにread.csvする。
- fileEncoding="UTF-8-BOM"で試す（大文字と小文字を区別）
- 一部行／一部列のみをとりだしたテストファイルを作って状況が再現するか確かめる。
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KojiDoi
2020/01/28 15:41
そのsamples.csvはどのようにして作ったものでしょうか。
i113
2020/01/28 15:59
どうも有難うございます。
人からもらったxlsxファイルの一部を新しく開いたエクセルシートにコピペしてcsvで保存したものです。