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python環境におけるscipyのインストールについて

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kaniha

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python 3.6.8を現在使用しています。
先日scipyを利用しようと思いインストールを試みました。

pip3 install scipy


上記のコマンドを実行した結果、

Collecting scipy
  Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/04/ab/e2eb3e3f90b9363040a3d885ccc5c79fe20c5b8a3caa8fe3bf47ff653260/scipy-1.4.1.tar.gz
Building wheels for collected packages: scipy
  Running setup.py bdist_wheel for scipy ... error
  Complete output from command /usr/bin/python3 -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-build-apk6uosh/scipy/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" bdist_wheel -d /tmp/tmp29zwm4fypip-wheel- --python-tag cp36:
  Running from scipy source directory.
  lapack_opt_info:
  lapack_mkl_info:
  customize UnixCCompiler
    libraries mkl_rt not found in ['/usr/local/lib', '/usr/lib', '/usr/lib/aarch64-linux-gnu']
    NOT AVAILABLE


赤字エラー

Command "/usr/bin/python3 -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-build-hd8i2_kd/scipy/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-ke7lwy9d-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --user --prefix=" failed with error code 1 in /tmp/pip-build-hd8i2_kd/scipy


以下とてつもなく長いエラー文が表示されました。
まだ勉強して日が浅いです。
わかる方ご教授お願いします。

※追記
jetson nanoというデバイスを使用しています。
pythonのインストールはデバイス購入時に流れ作業で行ってしまったため覚えていません。
OSはUbuntu 18.04 LTSとなっています。
エラーすべて入れようとしたところ字数制限によりすべて載せることが不可能だったので赤字エラーのみ追記しました。

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  • hayataka2049

    2020/01/24 19:23 編集

    > 以下とてつもなく長いエラー文
    すべて掲載してください
    また、環境等を書いてください(OSやpythonをインストールした方法など)。

    キャンセル

  • kaniha

    2020/01/24 19:56

    ありがとう御座います。情報を更新しました。
    エラー文に関してなのですがターミナルのほとんど最上位から最下位までのものになってしまいます。掲載に時間がかかりますのでまた更新します。

    キャンセル

回答 3

checkベストアンサー

0

特殊な環境なので、特有のtipsみたいなのを探したほうが早いかもしれません。たとえばこんなのが見つかりました。

cannot import scipy on jetson nano - NVIDIA Developer Forums
install scipy on jetson nano - NVIDIA Developer Forums

権限と依存をチェックして問題があったら直す、そもそもpipにこだわらないでOSのパッケージマネージャ(apt)から入れるといったソリューションがありそうです。

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libraries mkl_rt not found

mkl : Math Kernel Library が必要なようですね。
参考: https://qiita.com/unnonouno/items/8ab453a1868d77a93679

私の環境では mkl がない状態で scipy をインストールできてしまったけど、何かスイッチがあるのかな?

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  • 2020/01/25 03:50 編集

    LAPACKの実装が何かしら見つかればそれを使うので、MKL自体はなくても動きます。openblasとか。

    キャンセル

0

解決いたしました。報告が遅くなってしまい申し訳ありません。回答してくれたお二方ありがとうございました。

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