Atomでnumpyなどのファイルがインポートできません。通常のpython3でなく、AnacondaでAtomから実行したいです。

Python初心者です。jupyter notebookを使ってプログラムを書いていたのですが、atomというエディタを知りダウンロードしました。atom-runnerを導入してatomからすぐに実行できるようにしようと思ったのですが、numpy、matplotlibがインポートできずにうまくいきません。

試したこととしては、普通に動いている①ターミナル②jupyter notebookと、動いていない③Atom上でのpythonが違うのではと思い、調べてみたところ①と②ではAnacondaでのpythonが使われており、③ではそれよりも前にダウンロードしたpython3が使われているっぽいとわかったため、python3の方を削除しようと思いアンインストールをしました。こちらの記事を参考にしました。

その後もう一度

python
1import sys
2print(sys.exec_prefix)

で調べたところ、
①ターミナルではUsers/名前/anaconda3
②jupyter notebookでもUsers/名前/anaconda3であり、
③のみ/Library/Developer/CommandLineTools/Library/Frameworks/Python3.framework/Versions/3.7
と表示されました。

まだanaconda以外のpythonが残っているのでしょうか。
最終的にはAtomから、ターミナルと同じようにAnacondaのpythonを使って作業ができるようになればと思っております。