それぞれの平均値をとり、npyを簡単にまとめる方法

前提・実現したいこと

３行目の数が同じであるものの１行目と２行目の平均値をとりたい。
また、data1~9を簡単にまとめれる方法あれば教えていただいきたい。

発生している問題・エラーメッセージ

RuntimeWarning: invalid value encountered in double_scalars
  ret = ret.dtype.type(ret / rcount)
Traceback (most recent call last):
  File "seton2.py", line 19, in <module>
    dat[i][2]=data[data[:,3]==i,1].mean()
ValueError: cannot convert float NaN to integer

該当のソースコード

python

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
num=2019050101                                                                                                        dat=np.array([[0]*4 for i in range(90)])                                                                              data1 = np.load('./'+str(num)+'save.npy')
data2 = np.load('./'+str(num+1)+'save.npy')
data3 = np.load('./'+str(num+2)+'save.npy')
data4 = np.load('./'+str(num+3)+'save.npy')
data5 = np.load('./'+str(num+4)+'save.npy')
data6 = np.load('./'+str(num+5)+'save.npy')
data7 = np.load('./'+str(num+6)+'save.npy')
data8 = np.load('./'+str(num+7)+'save.npy')
data9 = np.load('./'+str(num+8)+'save.npy')
data=np.concatenate([data1,data2,data3,data4,data5,data6,data7,data8,data9])
for i in range(90):                                         
    dat[i][0]=i
    dat[i][1]=(data[:,3]==i).sum()
    dat[i][2]=data[data[:,3]==i,1].mean()                                                                                 
    dat[i][3]=data[data[:,3]==i,2].mean()                       
print(dat)