CentOSに入れたRedmine(Bitnami)のApacheが　something went wrong

前提・実現したいこと

VPSのCentOSにBitnamiのRedmineをインストールして利用したい。
インストール自体は完了し、一旦は使用できていた。

プラグインを導入するためにBundlerをインストールしようとしたところ、rubyが見つからないなどのエラーが発生していくつかのインストール作業を行った。（まだプラグイン自体は入れていない）
この辺りは細かい記録を残せていないので曖昧ですが、おそらく以下のQiitaを参考にしました。

エラーが出ていたかどうかは申し訳ないですが覚えていません。

ドメイン名の設定等Redmineとは関係のない理由でVPSを再起動したところ、Redmineにアクセスできなくなった。

発生している問題・エラーメッセージ

Redmineへアクセスした際のエラー画面

/opt/redmine-4.0.5-6/apache2/logs/error_log の内容

App 28860 output:     /opt/redmine-4.0.5-6/ruby/lib/ruby/gems/2.5.0/gems/passenger-5.3.7/src/helper-scripts/rack-preloader.rb:189:in `block in <module:App>'
App 28860 output:     /opt/redmine-4.0.5-6/ruby/lib/ruby/gems/2.5.0/gems/passenger-5.3.7/src/ruby_supportlib/phusion_passenger/loader_shared_helpers.rb:380:in `run_block_and_record_step_progress'
App 28860 output:     /opt/redmine-4.0.5-6/ruby/lib/ruby/gems/2.5.0/gems/passenger-5.3.7/src/helper-scripts/rack-preloader.rb:188:in `<module:App>'
App 28860 output:     /opt/redmine-4.0.5-6/ruby/lib/ruby/gems/2.5.0/gems/passenger-5.3.7/src/helper-scripts/rack-preloader.rb:30:in `<module:PhusionPassenger>'
App 28860 output:     /opt/redmine-4.0.5-6/ruby/lib/ruby/gems/2.5.0/gems/passenger-5.3.7/src/helper-scripts/rack-preloader.rb:29:in `<main>'
[ E 2020-01-04 21:45:11.0480 28755/Tj age/Cor/App/Implementation.cpp:221 ]: Could not spawn process for application /opt/redmine-4.0.5-6/apps/redmine/htdocs/: The application encountered the following error: Could not find rake-13.0.1 in any of the sources (Bundler::GemNotFound)
  Error ID: 1c87109e
  Error details saved to: /tmp/passenger-error-luhteG.html

[ E 2020-01-04 21:45:11.0512 28755/T9 age/Cor/Con/CheckoutSession.cpp:276 ]: [Client 2-1] Cannot checkout session because a spawning error occurred. The identifier of the error is 1c87109e. Please see earlier logs for details about the error.

試したこと

Qiitaを参考に Gemfile.lock の削除
Qiitaを参考に --path vendor/cache を指定

補足

素人のため関係あるかは分かりませんが、apacheの再起動時に必ずPassenger関連ぽい警告が発生します。

# /opt/redmine-4.0.5-6/ctlscript.sh restart
WARNING: PassengerPreStart cannot occur within <VirtualHost> section
WARNING: PassengerPreStart cannot occur within <VirtualHost> section
Syntax OK
/opt/redmine-4.0.5-6/apache2/scripts/ctl.sh : httpd stopped
/opt/redmine-4.0.5-6/mysql/scripts/ctl.sh : mysql stopped
/opt/redmine-4.0.5-6/mysql/scripts/ctl.sh : mysql  started at port 3306
WARNING: PassengerPreStart cannot occur within <VirtualHost> section
WARNING: PassengerPreStart cannot occur within <VirtualHost> section
Syntax OK
WARNING: PassengerPreStart cannot occur within <VirtualHost> section
WARNING: PassengerPreStart cannot occur within <VirtualHost> section
/opt/redmine-4.0.5-6/apache2/scripts/ctl.sh : httpd started at port 80

CHERRY

2020/01/05 00:31

プラグインの種類やバージョンが不明ですので、プラグイン名とバージョンを記載していただけないでしょうか。また、プラグインをインストール(追加)したときの手順を具体的に記載していただけないでしょうか？下記のドキュメントの手順でしょうか？　インストールの際に画面に表示されたメッセージで、異常はありませんでしたか？ https://docs.bitnami.com/bch/apps/redmine/configuration/install-plugins/

shun_kuwa

2020/01/05 05:39

投稿ありがとうございます。前提条件に追記いたしました。残念ながらログが残っておりませんのでやったことの詳細はわからないのですが、他に必要な情報があれば、現時点の環境から取得できる情報なら取得いたします。

take88

2020/01/07 03:06

プラグインがご使用中のRedmineバージョンをサポートしているのかが気になりますね。 Redmine のバージョンと、プラグインの名前、プラグインのバージョンを教えてもらえますか。

shun_kuwa

2020/01/07 09:41

プラグインは入れておりません。プラグインを入れる準備のために、Bundlerなどのインストールを行なった状況です。 Redmineは4.0.Xだったと思います。

take88

2020/01/07 09:57

なるほど。何を行ったか不明な状態だと回答は難しそうですね。1から作り直すほうが早そうにも感じますが、それは難しいですか？