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Linux

Linuxは、Unixをベースにして開発されたオペレーティングシステムです。日本では「リナックス」と呼ばれています。 主にWebサーバやDNSサーバ、イントラネットなどのサーバ用OSとして利用されています。 上位500のスーパーコンピュータの90%以上はLinuxを使用しています。 携帯端末用のプラットフォームAndroidは、Linuxカーネル上に構築されています。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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Q&A

1回答

1008閲覧

pycharmで特定の文字(”hypothetical protein”)を含む列の数をカウントしたいです。

tanakatsuki

総合スコア4

Linux

Linuxは、Unixをベースにして開発されたオペレーティングシステムです。日本では「リナックス」と呼ばれています。 主にWebサーバやDNSサーバ、イントラネットなどのサーバ用OSとして利用されています。 上位500のスーパーコンピュータの90%以上はLinuxを使用しています。 携帯端末用のプラットフォームAndroidは、Linuxカーネル上に構築されています。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2019/12/10 09:21

編集2019/12/12 07:09

イメージ説明イメージ説明### 前提・実現したいこと
画像内で青ペンで囲っている(hypothetical protein)を含む行数はどのように求められるのでしょうか?(hypothetical proteinが含まれる行の数のみを求めたいです)
ファイル名(NC_000964.ptt)から画像のデータリストを抽出し、pycharmで実装したいです

発生している問題・エラーメッセージ

エラーメッセージ

該当のソースコード

python

### 試したこと import pandas as pd df = pd.read_fwf('/home/ubuntu/works/BS_168/NC_000964.ptt') print(df["Product"].str.contains("hypothetical protein").sum()) ### 補足情報(FW/ツールのバージョンなど) ここにより詳細な情報を記載してください。

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回答1

0

python

1df["Product"].str.contains("hypothetical protein").sum()

でいかがでしょうか。

投稿2019/12/10 09:23

hayataka2049

総合スコア30933

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tanakatsuki

2019/12/12 07:07

ご回答ありがとうございます。試してみたところエラーが出てしまいました。
tanakatsuki

2019/12/12 07:10

エラーメッセージの画像を追加しましたので、ご確認いただけると幸いです。
hayataka2049

2019/12/12 07:11

まず読み込みに失敗していますので、私の回答とは関係ないエラーかと思います。ご自身でご確認ください。
tanakatsuki

2019/12/12 08:21

ありがとうございます。
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