WordPress のテーマで、カテゴリー数や投稿数の件数が影響する部分はあまり思いつかないのですが...
WordPress の物理的な上限としては、データベースのデータの上限でしょうか。
カテゴリーやタグ等の wp_terms の term_id が、bigint(20) UNSIGNED なので、最大 18446744073709551615 個のデータが保存できます。
実際の使用状況はよくわかりませんが、過去に見たサイトで、街の情報?を紹介しているようなサイトと思いましたが、市町村をカテゴリーで対応していたサイトがあったので、もし全国の市町村に対応しているとすれば、1,800弱のカテゴリーを用意していたのではないかと思います。
( 市区町村数を調べる - 統計で見る日本 より 全国の市町村の合計が 1,724 で、都道府県 47 を足して 1,771 個と仮定して... )
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