Wordpress パーマリンク設定の『変更を保存』すると、」カスタム投稿の記事が404エラーになる。

WordPressバージョン 5.2.3
PHP7.2.17

問題
WordPressでカスタム投稿の記事が404エラーになってしまう。
通常のブログ（投稿）に関しては、問題なく表示される。

カスタム投稿のアーカイブページには、記事タイトルやサムネイル、属するタームなどは取得でき、表示もできている。

カスタム投稿はfunctions.phpに記述して、プラグインなどでは作成していない。

以前は正しく表示されていたため、その頃のデータをインポートすると、カスタム投稿の記事が表示される。
しかし、何も変更せずにパーマリンク設定の『変更を保存』をクリックすると、またカスタム投稿の記事が404エラーになる。

パーマリンク設定に関することを変更したりすると、404エラーが出るので、そのあたりの問題だと思いますが、何か原因のわかる方はいらっしゃれば教えていただきたいです。

追記

パーマリンクを書き換えるプラグイン『Custom Post Type Permalinks』を使用しています。

カスタム投稿タイプはfunctions.phpに以下のように設定しています。

html
1add_action( 'init', 'create_post_type' );
2function create_post_type() {
3	$Supports = [ 
4    'title',
5    'editor',
6    'thumbnail',
7    'revisions'
8	];
9	
10	register_post_type('activities',
11		array(
12			'label' => '活動',
13			'public' => true,
14			'show_ui' => true,
15			'show_in_menu' => true,
16			'capability_type' => 'post',
17			'rewrite' => array( 'slug' => 'activities'),
18			'hierarchical' => true,
19            'show_in_rest' => true,
20			'query_var' => false,
21			'has_archive' => true,
22			'exclude_from_search' => false,
23			'menu_position' => 5,
24			'supports' => $Supports 
25		)
26	);
27	register_taxonomy(
28		'activities_cat',
29		'activities',
30		array(
31			'hierarchical' => true,
32			'label' => '活動カテゴリー',
33			'show_ui' => true,
34			'query_var' => true,
35			'show_in_rest' => true,
36			'rewrite' => array('slug' => 'activities'),
37			'singular_label' => '活動カテゴリー',
38			'show_admin_column' => true
39		)
40	);
41	register_post_type('works',
42		array(
43			'label' => '仕事',
44			'public' => true,
45			'show_ui' => true,
46			'show_in_menu' => true,
47			'capability_type' => 'post',
48			'rewrite' => array( 'slug' => 'works'),
49			'hierarchical' => true,
50            'show_in_rest' => true,
51			'query_var' => false,
52			'has_archive' => true,
53			'exclude_from_search' => false,
54			'menu_position' => 5,
55			'supports' => $Supports 
56		)
57	);
58}
59add_rewrite_rule('activities/([^/]+)/page/([0-9]+)/?$', 'index.php?activities_cat=$matches[1]&paged=$matches[2]', 'top');
60