Q&A
まずは、「最大値がその行の2番目に大きい値の2倍を超える行」をどのように見いだすのかをお考えになってはいかがでしょうか。
一つ一つ解決していくべきでしょう。
csvファイルから出力した2次元配列において、最大値がその行の2番目に大きい値の2倍を超える行に対して、
グラフのタイトルに「その行の0番目の要素(この場合"A"から"C"まで)」,
x軸に「1行目の文字列(この場合"One"から"Five"まで)」,
y軸に「最大値」
の順に表示されるようにしたいと思っています。
参考までに、僕の実力で書いた未完のコードと、エラーメッセージを下に記しておきます。
宜しくお願いします。
出力例
Fredens et al., 2019から引用してきたグラフを貼っておきます。
(https://www.nature.com/articles/s41586-019-1192-5)
今回の場合と照らし合わせると、
Genome~となっている所に0番目の要素(A,B,C),
ローマ数字が記されている所(x軸)に1行目の文字列(One,Two,Three,Four,Five),
数字が書かれている所(y軸)には最大値の数値に応じた幅の目盛りに加え,
x軸の目盛り毎に数値に応じた長さ分の棒が生えていて欲しいと考えています。
エラー
Traceback (most recent call last) <ipython-input-7-e82219d9ca7b> in <module> 10 left = idx 11 height = df.iloc[:] ---> 12 plt.bar(left, height, align="center", width=1.0) TypeError: only size-1 arrays can be converted to Python scalars
ファイル
renshu.csv
1Name,One,Two,Three,Four,Five 2A,3,3,14,4,2 3B,3,2,2,4,5 4C,3,2,8,4,10
コード
renshu.py
1import pandas as pd 2import numpy as np 3import matplotlib.pyplot as plt 4 5df = pd.read_csv('renshu.csv', index_col='Name') 6for idx, row in df.iterrows(): 7 tmp = row.sort_values(ascending=False) 8 if tmp.iloc[0] >= tmp.iloc[1] * 2: 9 plt.title = tmp.index[0] 10 left = idx 11 height = df.iloc[:] 12 plt.bar(left, height, align="center", width=1.0)
補足情報（FW/ツールのバージョンなど）
iOS 10.14.6, Python 3.7.4, Atom
大変失礼致しました。
if文の下にplt.title = ~(以下略)ではなく、print(idx)とする事で可能になる、と思っているのですが如何でしょうか？
もし違っているようであれば遠慮なく教えていただけますと幸いです。
実際に確認しているのでしょうか？ご提示のコードとデータで期待通りの結果を得られていますか？
if文の下をprint(idx)に置き換える事で対象となる行が表示される、というのは確認済みです。
開き直るようで恐縮ですが、作図をしようとした結果であります、質問のコードとして記したplt.title~が色々とおかしくなっているのは完全に自分の無知によるものです。申し訳ございません。
理解しました。さて、どのようなグラフを期待していますか？すでに回答されている内容で（そのままコードをコピペできないながらも）意図は含まれていると思いますが。
サンプルのように一つだけ抽出した場合、結果は一つだけですよね。でもxは5つ必要です。
追記しました。
内容に不足があれば遠慮なくお申し付け下さい。
又、質問で提示したファイルはあくまで仮のものに過ぎず、実際の解析対象となるcsvファイルに格納されている情報は100*100スケールのものであり、対象となる行のセレクションをかける事は前述のやり取りで可能にはなったものの、それらの数値を手打ちしてグラフを作成するのは些か非現実であると感じています。
ファイルの数値を代入してグラフのセッティングを行えるようなやり方ができればそれに越した事はないのですが、その点に関して如何お考えでしょうか？
回答1件
0
ベストアンサー
leftとheightは同じ数必要かと思います。（同じ長さの配列にする）
【追記】
Python
1import matplotlib.pyplot as plt 2 3left = [1,2,3,4] 4height = [4,3,2,1] 5plt.bar(left, height, align="center", width=1.0) 6plt.show()
【追記】こんな感じでしょうか？ ※X軸の順番が期待通りではないかも
Pytohn
1for idx, row in df.iterrows(): 2 plt.bar(df.columns, row.values.tolist(), align="center", width=1.0,tick_label=df.columns) 3 plt.title = df.index 4 plt.show()
投稿2019/08/28 08:59
編集2019/08/28 22:21
総合スコア10579
こちらの理解力不足で恐縮ですが、具体的にどういう事でしょうか？
有難うございます。納得しました。
しかしながら大変恐縮ですが、質問で提示したファイルはあくまで仮のものに過ぎず、実際の解析対象となるcsvファイルに格納されている情報は100*100スケールのものであり、対象となる行のセレクションをかけた上でそれらの数値を手打ちしてグラフを作成する、というのは些か非現実的だと思っております。
もしファイルの数値を代入してグラフのセッティングを行えるようなやり方をご存知でしたら、後学の為に教えて頂けますと大変嬉しいです。宜しくお願い致します。
アウトプットとして欲しいグラフは何ですか？
例のテキストファイルですと、どんなグラフが最終的に欲しいのか教えてください。（手書きでもエクセルグラフでも良いので画像を追加してほしいです）
追記しました。
内容に不足があれば遠慮なくお申し付け下さい。
本当に助かります、有難うございました！
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