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matplotlibとseabornで作成した図がplt.savefigでうまく保存されない。

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matplotlibとseabornを使って作成したfigureを保存する。

言語:Python
matplotlibとseabornを使って作成したfigureを保存しようとしています。
IPython上でplt.showした際の図は望み通りの出力になっていますが、plt.savefigした際の図はタイトルや軸ラベルが消えてしまいます。

発生している問題・エラーメッセージ

IPython上で表示される図

PCに保存される図

![イメージ説明](d7d6fc0c300b0ecc1626b1dcf38b20f4.png)

該当のソースコード

import numpy as  np
import pandas as pd
from matplotlib import pyplot as plt
import seaborn as sns

sns.set()
sns.set_style('whitegrid')
sns.set_palette('Set3')

np.random.seed(2018)

df = pd.DataFrame({
    'leaf': np.random.normal(10, 2, 20),
    'stem': np.random.normal(15, 3, 20),
    'root': np.random.normal(5, 1, 20)
})

df_melt = pd.melt(df)

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1, 1, 1)
#sns.boxplot(x='variable', y='value', data=df_melt, showfliers=False, ax=ax)
sns.barplot(x='variable', y='value', data=df_melt, ax=ax)
sns.stripplot(x='variable', y='value', data=df_melt, jitter=True, color='#e41a1c', ax=ax)
ax.set_title('Title')
plt.ylim(0,1)
plt.savefig('test.png')
plt.show()

試したこと

plt.savefig('test.png')

plt.savefig('test.png', bbox_inches='tight')
に変更する。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

Python (3.6.8 64bit 'base':conda)、OS:macOS10.14.4、エディタ:vs code 1.35.1

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  • bamboo-nova

    2019/07/20 19:40

    ipythonのtheme colorがdarkだったりしませんか?

    キャンセル

  • tachi-as

    2019/07/20 22:29

    vs codeのthemeはdark (black?)です。こちらが問題なのでしょうか?

    キャンセル

  • bamboo-nova

    2019/07/20 23:18

    一応、同様の開発環境を作って動かして見ましたが、問題なく動きました。
    バグっぽいですね...唯一違うとしたらmojaveとhigh Sierraくらい汗

    他の開発環境(Jupyter LabやJupyter Notebook)で動かしても同様の出力になりますか?

    キャンセル

  • tachi-as

    2019/07/21 00:18

    bamboo-nova さま
    ご指摘ありがとうございました。hayataka2049様のご指摘で先に解決できましたが、bamboo-nova様がおっしゃられていた通り、IPythonのtheme colorの問題だったようです。親切にご回答くださりありがとうございました。

    キャンセル

回答 1

checkベストアンサー

0

詳しい状況はわからないけど、この辺↓を強制的に"white"に設定すれば白背景で保存できるはずです。

>>> import matplotlib as mpl
>>> [x for x in mpl.rcParams.keys() if "facecolor" in x]
['axes.facecolor', 'boxplot.flierprops.markerfacecolor', 'boxplot.meanprops.markerfacecolor', 'figure.facecolor', 'legend.facecolor', 'lines.markerfacecolor', 'patch.facecolor', 'savefig.facecolor']


設定の変え方の例。

mpl.rcParams["figure.facecolor"] = "white"

探すときは、

print([(k, v) for k, v in mpl.rcParams.items() if "facecolor" in k and v != "white"])


とかやって怪しいやつを探すとスマートかも。

あとはIPython(Jupyter)上でずっと作業しているのなら以前にやった変な設定が残っていて、単にカーネルリスタートでリセットすれば治るというパターンかもしれません。質問文の記述だとどちらともわかりませんが、そういう可能性もあるのかなと思いました。

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  • 2019/07/21 00:16

    mpl.rcParams.keys()で各設定を見られるのを知りませんでした。ありがとうございます!
    IPythonと表記したのはvs code の拡張機能でのIPythonのこのでしたが、原因としては、'savefig.facecolor'が'black'になっている点でした。ご回答感謝いたします。

    キャンセル

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