RailsでDBに登録した時間が日本時間にならない

環境

OS: Ubuntu
OSバージョン: 18.04.2
rubyバージョン: 2.5.5
railsバージョン: Rails 5.2.3
mysqlバージョン： mysql Ver 14.14 Distrib 5.7.26, for Linux (x86_64) using EditLine wrapper

RailsでDBのマイグレーションファイルを以下のようにかきました．

# coding: utf-8
class CreateUsers < ActiveRecord::Migration[5.2]
  def change
    create_table :users do |t|
      t.timestamps
    end
  end
end

これで新しいレコードを登録した時にcreated_atとupdated_atが自動で作成されます．
しかし，作成されたレコードを見ると日本時間からー9時間の時間になっていました．
Railsで日本時間に設定したり，使用OSの時間，mysqlも確認しましたができませんでした．
どうすれば，日本時間にすることができますか？

試したこと

OSの時間の確認

#シェル上で
$ date                                                                                                               
Fri Jun  7 13:34:23 JST 2019

Railsのタイムゾーン設定

#config/application.rbにconfig.time_zone = 'Tokyo'を追記
(前略)
module OpinionApp
  class Application < Rails::Application
    config.load_defaults 5.2
    config.time_zone = 'Tokyo'
  end
end

Railsコンソールでの確認

$ rails c production
irb(main):001:0> Time.now
=> 2019-06-07 13:37:25 +0900

Mysqlのタイムゾーン

mysql> show variables like '%time_zone%';
+------------------+--------+
| Variable_name    | Value  |
+------------------+--------+
| system_time_zone | JST    |
| time_zone        | SYSTEM |
+------------------+--------+