Cygwin上でPandas、Scipy ,matplotlibがインストールできません

Question

Cygwin上でPandasやScipyなどのインストールを試しています。
シミュレーションのプログラムを動かすうえで上記のパッケージをインストールしたいのですが

Python3 -m pip install matplotlib
を書いた後多くの赤字が出て、すべての場合で以下のエラーメッセージが発生しました。

    ERROR: Complete output from command /usr/bin/Python3 -u -c 'import setuptools, tokenize;__file__='"'"'/tmp/pip-install-2iedylp7/kiwisolver/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' install --record /tmp/pip-record-2u43qpmd/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile:
    ERROR: running install
    running build
    running build_ext
    building 'kiwisolver' extension
    creating build
    creating build/temp.cygwin-3.0.7-x86_64-3.6
    creating build/temp.cygwin-3.0.7-x86_64-3.6/py
    gcc -Wno-unused-result -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -ggdb -O2 -pipe -Wall -Werror=format-security -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -fdebug-prefix-map=/usr/src/ports/python36/python36-3.6.8-1.x86_64/build=/usr/src/debug/python36-3.6.8-1 -fdebug-prefix-map=/usr/src/ports/python36/python36-3.6.8-1.x86_64/src/Python-3.6.8=/usr/src/debug/python36-3.6.8-1 -ggdb -O2 -pipe -Wall -Werror=format-security -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -fdebug-prefix-map=/usr/src/ports/python36/python36-3.6.8-1.x86_64/build=/usr/src/debug/python36-3.6.8-1 -fdebug-prefix-map=/usr/src/ports/python36/python36-3.6.8-1.x86_64/src/Python-3.6.8=/usr/src/debug/python36-3.6.8-1 -I. -I/usr/include/python3.6m -c py/kiwisolver.cpp -o build/temp.cygwin-3.0.7-x86_64-3.6/py/kiwisolver.o
    In file included from py/kiwisolver.cpp:8:0:
    /usr/include/python3.6m/Python.h:39:10: fatal error: crypt.h: No such file or directory
     #include <crypt.h>
              ^~~~~~~~~
    compilation terminated.
    error: command 'gcc' failed with exit status 1
    ----------------------------------------
ERROR: Command "/usr/bin/Python3 -u -c 'import setuptools, tokenize;__file__='"'"'/tmp/pip-install-2iedylp7/kiwisolver/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' install --record /tmp/pip-record-2u43qpmd/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile" failed with error code 1 in /tmp/pip-install-2iedylp7/kiwisolver/

試したこと

katsuko様のおっしゃったとおりPython3-develをいれたところエラーの内容が変わりましたこれもまた何か足りないのでしょうか。、

Comments

[hayataka2049]

もうちょっと長いメッセージが出ていそうな気もするので、コマンドを打って以降に出てくるものはすべて示すように編集してください。また、エラーは<code>ボタンで挿入できるコードブロックの中に入れて、綺麗表示されるようにしてください。

[python-syosinns]

Pandas やScipyはエラーが三倍くらいでて文字数制限で書き込めませんでした。編集方法まで教えていただいてありがとうございます。

Answer 1

    gcc -Wno-unused-result -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -ggdb -O2 -pipe -Wall -Werror=format-security -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -fdebug-prefix-map=/usr/src/ports/python36/python36-3.6.8-1.x86_64/build=/usr/src/debug/python36-3.6.8-1 -fdebug-prefix-map=/usr/src/ports/python36/python36-3.6.8-1.x86_64/src/Python-3.6.8=/usr/src/debug/python36-3.6.8-1 -ggdb -O2 -pipe -Wall -Werror=format-security -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -fdebug-prefix-map=/usr/src/ports/python36/python36-3.6.8-1.x86_64/build=/usr/src/debug/python36-3.6.8-1 -fdebug-prefix-map=/usr/src/ports/python36/python36-3.6.8-1.x86_64/src/Python-3.6.8=/usr/src/debug/python36-3.6.8-1 -I. -I/usr/include/python3.6m -c py/kiwisolver.cpp -o build/temp.cygwin-3.0.7-x86_64-3.6/py/kiwisolver.o
    py/kiwisolver.cpp:8:10: fatal error: Python.h: No such file or directory
     #include <Python.h>
              ^~~~~~~~~~

「Python.h」が無いと言っていますから、Pythonの開発環境パッケージがインストールされていないのでしょう。
setup.exeを実行して、「python3-devel」パッケージをインストールしてみてください。

---

    /usr/include/python3.6m/Python.h:39:10: fatal error: crypt.h: No such file or directory

「libcrypt-devel」パッケージですね。

• No crypt.h for cygwin64?

cygwinはlinuxのディストリビューションと同様、デフォルトでは開発用パッケージはインストールされていません。

また、pipでインストールするパッケージの中には、CやC++でのビルドが必要なものもあり、それらの場合開発環境を整えなければなりません。

今回の「crypt.h」はパッとは思いつかなかったので、「cygwin crypt.h」で検索して、上記のサイトを見つけました。
同様のエラーが出た場合には、同様に検索すると解決できるかもしれません。

Comments

[python-syosinns]

Katsuko様、ありがとうございました
実は同じサイト一度拝見しておりました。そのときは、自信がなかったのでスルーしたんですがkatsuko様のお陰でmatplotlibとpandasのinstallに成功しました。scipyはまたエラーを吐いたのでまた少し眺めてみようとおもいます。ありがとうございました！