mac PATH について

前提・実現したいこと

macのPATHについて質問です。

今回、急にcondaをはじめとし、Anacona-navigatorなども動かなくなりました。

$ conda
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/username/anaconda3/bin/conda", line 12, in <module>
    from conda.cli import main
ModuleNotFoundError: No module named 'conda'

（ユーザーネームはusernameに置き換えてあります）

そこでPATHを確認してみました。

$ echo $PATH
~/anaconda3/bin:/Users/username/anaconda3/bin:/Users/username/Programs/bin:/Users/username/Contents/Home/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/usr/local/ncbi/blast/bin:/Library/TeX/texbin:/usr/local/share/dotnet:/opt/X11/bin:~/.dotnet/tools:/Library/Frameworks/Mono.framework/Versions/Current/Commands

.bashrcや.bash_profileのPATHに問題があると思い確認してみたのですが、

.bashrc

export PATH=$PATH:~/anaconda3/bin:/Users/username/Programs/bin:/Users/username/Contents/Home/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin

.bash_profile

export PATH=~/anaconda3/bin:$HOME/Programs/bin:$HOME/Contents/Home/bin:$PATH

# added by Anaconda3 5.3.1 installer
# >>> conda init >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$(CONDA_REPORT_ERRORS=false '~/anaconda3/bin/conda' shell.bash hook 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; then
    \eval "$__conda_setup"
else
    if [ -f "~/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
        . "~/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
        CONDA_CHANGEPS1=false conda activate base
    else
        \export PATH="~/anaconda3/bin:$PATH"
    fi
fi
unset __conda_setup
# <<< conda init <<<

if [ -f ~/.bashrc ] ; then
. ~/.bashrc
fi

test -r ~/.bashrc && . ~/.bashrc

となっており、echo $PATHで見たものとPATHが一致しません。
bashrcやbash_profileを書き換えてsourceしてもPATHが変更されません。

PATHを設定するファイルは他にもあるのでしょうか？

/Library/TeX/texbin:などのPATHは追加した覚えはあるのですが、どうやって追加したかが思い出せません。

ひとまずcondaが動くようにしたいです。
よろしくお願いします。