Q&A
yの値が全て'1'なのはたまたまですか？
下記、普通にロジスティック回帰をしていますが、なぜか以下のようなエラーがでるときとそうでないときがあります。調べてみると、sklearnのバグだとという方もいましたがそうだと思い難いです。
なにかお気づきの点ありがましたらご教示いただけませんでしょうか？
# ロジスティック回帰の計算処理 def _calc_logreg(X_train, y_train): logreg = LogisticRegression(solver='lbfgs') logreg.fit(X_train, y_train) slope = logreg.coef_[0, 0] intercept = logreg.intercept_[0] return slope, intercept
テストコードとエラー画面
def test_make_params(): graph_id = 'Test' ability = ["Z1", "Z2", "Z3", "A1", "A2", "A3", "B1", "B2", "B3", "C1", "C2", "C3", "DD1", "DD2", "DD3"] lists = [['Question'+str(random.randint(1, 10)), random.choice(ability), random.randint(0, 1)] for j in range(100)] two_arrays = np.array(lists) > assert len(make_params(graph_id, two_arrays)) == 10 tests/test_estimater.py:15: _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ self = LogisticRegression(C=1.0, class_weight=None, dual=False, fit_intercept=True, intercept_scaling=1, max_iter=1... n_jobs=None, penalty='l2', random_state=None, solver='lbfgs', tol=0.0001, verbose=0, warm_start=False) X = array([[ 1.9], [-1.3], [ 2.8], [ 2.3], [ 1.5], [-0.4], [ 0.8], [-0.4], [ 0. ], [ 1.9], [ 2.3], [-1.7], [ 0.4]]) y = array(['1', '1', '1', '1', '1', '1', '1', '1', '1', '1', '1', '1', '1'], dtype='<U1') sample_weight = None def fit(self, X, y, sample_weight=None): """Fit the model according to the given training data. Parameters ---------- X : {array-like, sparse matrix}, shape (n_samples, n_features) Training vector, where n_samples is the number of samples and n_features is the number of features. y : array-like, shape (n_samples,) Target vector relative to X. sample_weight : array-like, shape (n_samples,) optional Array of weights that are assigned to individual samples. If not provided, then each sample is given unit weight. .. versionadded:: 0.17 *sample_weight* support to LogisticRegression. Returns ------- self : object """ if not isinstance(self.C, numbers.Number) or self.C < 0: raise ValueError("Penalty term must be positive; got (C=%r)" % self.C) if not isinstance(self.max_iter, numbers.Number) or self.max_iter < 0: raise ValueError("Maximum number of iteration must be positive;" " got (max_iter=%r)" % self.max_iter) if not isinstance(self.tol, numbers.Number) or self.tol < 0: raise ValueError("Tolerance for stopping criteria must be " "positive; got (tol=%r)" % self.tol) solver = _check_solver(self.solver, self.penalty, self.dual) if solver in ['newton-cg']: _dtype = [np.float64, np.float32] else: _dtype = np.float64 X, y = check_X_y(X, y, accept_sparse='csr', dtype=_dtype, order="C", accept_large_sparse=solver != 'liblinear') check_classification_targets(y) self.classes_ = np.unique(y) n_samples, n_features = X.shape multi_class = _check_multi_class(self.multi_class, solver, len(self.classes_)) if solver == 'liblinear': if effective_n_jobs(self.n_jobs) != 1: warnings.warn("'n_jobs' > 1 does not have any effect when" " 'solver' is set to 'liblinear'. Got 'n_jobs'" " = {}.".format(effective_n_jobs(self.n_jobs))) self.coef_, self.intercept_, n_iter_ = _fit_liblinear( X, y, self.C, self.fit_intercept, self.intercept_scaling, self.class_weight, self.penalty, self.dual, self.verbose, self.max_iter, self.tol, self.random_state, sample_weight=sample_weight) self.n_iter_ = np.array([n_iter_]) return self if solver in ['sag', 'saga']: max_squared_sum = row_norms(X, squared=True).max() else: max_squared_sum = None n_classes = len(self.classes_) classes_ = self.classes_ if n_classes < 2: raise ValueError("This solver needs samples of at least 2 classes" " in the data, but the data contains only one" > " class: %r" % classes_[0]) E ValueError: This solver needs samples of at least 2 classes in the data, but the data contains only one class: '1' venv/lib/python3.7/site-packages/sklearn/linear_model/logistic.py:1319: ValueError ==================== 1 failed, 163 passed in 41.87 seconds =====================
下記でランダムにテストデータを生成しているのでランダムだと思っていますが、そうだとしても、実際のデータで全て1の可能性もあります。
lists = [['Question'+str(random.randint(1, 10)), random.choice(gtz),
random.randint(0, 1)] for j in range(100)]
エラー文の通りだと思います。2クラス分類なのに、1クラスしかデータがなかったら、分類できませんね。
> This solver needs samples of at least 2 classes in the data, but the data contains only one
はい、そうだと薄々とは認識していたものの、ランダムでテストデータを作成している。かつ、そういったケースも実際のデータでも可能性があります。
そういう場合のsklernのロジスティック回帰にオプションが何かあるのか気になっていました。もしくは、テストデータの作り方を変える必要があるかだと思ったりしています。
データの作り方を変える必要があるということです。ランダムという条件では問題があるのですから。
テストデータは、機械学習における精度を検証するためのテストデータではなく、テストコードを実行するためのデータを指して言っていますよね？
> 実際のデータでも可能性があります。
1つのクラスしかないデータでは、そもそも学習ということができないので、「実際のデータ」でそのような可能性はありえないと思いますがいかがでしょうか。
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ベストアンサー
E ValueError: This solver needs samples of at least 2 classes in the data, but the data contains only one class: '1'
そのまんまだと思いますが・・・
テストコードといいつつ_calc_logregが出現しないので何をどうテストしているのかわからないのですが、この場合考えるべきことは実際の運用で同様のケース（すべて同値のラベルが入力される）が考えられるかどうかです。
考えられる場合、修正依頼欄でも指摘があがっている通りそもそも分類が成立しませんから、何かしら適切なロジックで分岐させて分類器の学習まで行わないようにするか、最悪ValueErrorを拾ってエラーを出すようにします。
考えられない場合、テストケースがまずいというだけなので、すべて同値というケースにならないようテストデータの生成処理を変えます。
投稿2019/04/02 04:54
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