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Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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pythonのforループと関数の定義について

marama_ra

総合スコア13

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2019/03/27 09:36

python勉強中の者です。

DNA塩基中の5塩基がどのくらいの数あるか探す(例えばatgccが何個あるかわかる)ために以下のようなプログラムを組んだのですが、試験的に'atgctacgta'をdataに格納したところ、すべて0の表示が出てしまいます。def以降に問題があると思うのですが、どのように解決すればよいかわかりません。0ばかりになってしまう理由を教えていただけると幸いです。

よろしくお願いします。

python

1five_base=list(itertools.product('atgc',repeat=5)) 2new=[]##新しいリストの作成 必ずfor loopの前!! 3for x in five_base: 4 y=''.join(x)##間の','の削除 5 new.append(y)##リストに順番に並びを格納 6 7def find_five_base(data): 8 for x in new : ##xにnewを格納 9 print(data.count(x))

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4^5で1024個になるので膨大すぎて埋もれているだけで、ちゃんと結果は出ているかと。

python

1import itertools 2 3five_base=list(itertools.product('atgc',repeat=5)) 4new=[]##新しいリストの作成 必ずfor loopの前!! 5for x in five_base: 6 y=''.join(x)##間の','の削除 7 new.append(y)##リストに順番に並びを格納 8 9def find_five_base(data): 10 for x in new : ##xにnewを格納 11 cnt = data.count(x) 12 if cnt > 0: 13 print(x, cnt) 14 15find_five_base("atgctacgta") 16""" => 17atgct 1 18acgta 1 19tacgt 1 20tgcta 1 21gctac 1 22ctacg 1 23""" 24

なお、ある程度長いものになるとそのアルゴリズムで探すのは遅すぎて現実的ではないはずです(あ、でも一応O(N)ではあるか。1024回ループされるのが非効率というだけで)。一文字ずつ見る範囲をずらしながらカウントしていった方が効率的でしょう。

投稿2019/03/27 09:45

編集2019/03/27 09:57
hayataka2049

総合スコア30933

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marama_ra

2019/04/02 04:14

返信が遅くなってしまいすみません汗 回答ありがとうございますm(_)m 見落としていたのは迂闊でした.... まだプログラミングの速度についての知識がないので勉強してみます!
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