Can't find the 'libpq-fe.h header

Question

--------------------

find_header: checking for libpq-fe.h... -------------------- no

"gcc -o conftest -I/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/include/ruby-2.5.0/x86_64-linux -I/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/include/ruby-2.5.0/ruby/backward -I/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/include/ruby-2.5.0 -I.    -O3 -ggdb3 -Wall -Wextra -Wno-unused-parameter -Wno-parentheses -Wno-long-long -Wno-missing-field-initializers -Wno-tautological-compare -Wno-parentheses-equality -Wno-constant-logical-operand -Wno-self-assign -Wunused-variable -Wimplicit-int -Wpointer-arith -Wwrite-strings -Wdeclaration-after-statement -Wimplicit-function-declaration -Wdeprecated-declarations -Wno-packed-bitfield-compat -Wsuggest-attribute=noreturn -Wsuggest-attribute=format  -fPIC conftest.c  -L. -L/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/lib -Wl,-rpath,/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/lib -L. -fstack-protector -rdynamic -Wl,-export-dynamic     -Wl,-rpath,/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/lib -L/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/lib -lruby  -lpthread -ldl -lcrypt -lm   -lc"
checked program was:
/* begin */
1: #include "ruby.h"
2: 
3: int main(int argc, char **argv)
4: {
5:   return 0;
6: }
/* end */

"gcc -E -I/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/include/ruby-2.5.0/x86_64-linux -I/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/include/ruby-2.5.0/ruby/backward -I/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/include/ruby-2.5.0 -I.    -O3 -ggdb3 -Wall -Wextra -Wno-unused-parameter -Wno-parentheses -Wno-long-long -Wno-missing-field-initializers -Wno-tautological-compare -Wno-parentheses-equality -Wno-constant-logical-operand -Wno-self-assign -Wunused-variable -Wimplicit-int -Wpointer-arith -Wwrite-strings -Wdeclaration-after-statement -Wimplicit-function-declaration -Wdeprecated-declarations -Wno-packed-bitfield-compat -Wsuggest-attribute=noreturn -Wsuggest-attribute=format  -fPIC  conftest.c -o conftest.i"
conftest.c:3:22: fatal error: libpq-fe.h: No such file or directory
 #include <libpq-fe.h>
                      ^
compilation terminated.
checked program was:
/* begin */
1: #include "ruby.h"
2: 
3: #include <libpq-fe.h>
/* end */

--------------------
コード

Can't find the 'libpq-fe.h headerと書いてあったので
brew install postgresql
をしましたが
bash: brew: command not found
と出てしまい困っています。。。
初心者です。よろしくお願いいたします。

Comments

[kazto]

ご使用の環境はAmazonEC2で間違いないでしょうか？

[sairito0628]

はい、AmazonEC2で間違いないです。

[kazto]

すみません、今更の質問で申し訳ありませんが、「何をやろうとして」ご提示のエラー文が現れたのでしょうか？

Answer 1

AmazonLinuxでは、パッケージ管理コマンドはyumを使用します。

https://docs.aws.amazon.com/ja_jp/AWSEC2/latest/UserGuide/managing-software.html

以下で開発用パッケージをインストールしてください。

sudo yum install postgresql-devel

---

同じような事例を見つけました。

https://qiita.com/s-yank/items/035938249ba3b158b865

追加で以下のパッケージをインストールしてみてください。

sudo yum install postgresql96 postgresql96-server postgresql96-libs postgresql96-contrib postgresql96-devel

---

以下の要領で、まずはpg_configコマンドのありかを探します。

$ ls /usr
...(中略)... pgsql-9.x ...(中略)...

↓「ls /usr」の実行結果表示されたバージョン番号で、次のディレクトリを指定してください。
$ ls /usr/pgsql-9.x/bin
...(中略)... pg_config ...(中略)...

次に、見つかったディレクトリのパスを使って、「PATHを通し」ます。

~/.bash_profile に以下のように記載します。

export PATH=/usr/pgsql-9.x/bin:$PATH

最後に、それを読み込んで、PATHを有効化します。

$ source ~/.bash_profile

Comments

[sairito0628]

アンサーありがとうございます！
あと3時間ほどしたら家に帰るので、試してみます！でき次第またご連絡いたします。

[sairito0628]

こんな感じで出ました
ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ sudo yum install postgresql-devel
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
1060 packages excluded due to repository priority protections
Package postgresql92-devel-9.2.24-2.66.amzn1.x86_64 already installed and latest version
Nothing to do

[sairito0628]

sudo yum install postgresql96 postgresql96-server postgresql96-libs postgresql96-contrib postgresql96-devel
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
1060 packages excluded due to repository priority protections
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package postgresql96.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1 will be installed
---> Package postgresql96-contrib.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1 will be installed
--> Processing Dependency: libossp-uuid.so.16()(64bit) for package: postgresql96-contrib-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64
---> Package postgresql96-devel.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1 will be installed
---> Package postgresql96-libs.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1 will be installed
---> Package postgresql96-server.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1 will be installed
--> Running transaction check
---> Package uuid.x86_64 0:1.6.2-27.22.amzn1 will be installed
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved

==============================================================================================================
Package Arch Version Repository Size
==============================================================================================================
Installing:
postgresql96 x86_64 9.6.11-1.82.amzn1 amzn-updates 5.2 M
postgresql96-contrib x86_64 9.6.11-1.82.amzn1 amzn-updates 773 k
postgresql96-devel x86_64 9.6.11-1.82.amzn1 amzn-updates 1.3 M
postgresql96-libs x86_64 9.6.11-1.82.amzn1 amzn-updates 290 k
postgresql96-server x86_64 9.6.11-1.82.amzn1 amzn-updates 7.2 M
Installing for dependencies:
uuid x86_64 1.6.2-27.22.amzn1 amzn-main 58 k

Transaction Summary
==============================================================================================================
Install 5 Packages (+1 Dependent package)

Total download size: 15 M
Installed size: 48 M
Is this ok [y/d/N]: ok
Is this ok [y/d/N]: y
Downloading packages:
(1/6): postgresql96-devel-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64.rpm | 1.3 MB 00:00:01
(2/6): postgresql96-libs-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64.rpm | 290 kB 00:00:00
(3/6): postgresql96-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64.rpm | 5.2 MB 00:00:02
(4/6): postgresql96-contrib-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64.rpm | 773 kB 00:00:02
(5/6): uuid-1.6.2-27.22.amzn1.x86_64.rpm | 58 kB 00:00:00
(6/6): postgresql96-server-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64.rpm | 7.2 MB 00:00:01
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Total 4.6 MB/s | 15 MB 00:00:03
Running transaction check
Running transaction test
Transaction test succeeded
Running transaction
Installing : postgresql96-libs-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 1/6
Installing : postgresql96-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 2/6
Installing : uuid-1.6.2-27.22.amzn1.x86_64 3/6
Installing : postgresql96-contrib-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 4/6
Installing : postgresql96-server-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 5/6
Installing : postgresql96-devel-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 6/6
Verifying : postgresql96-libs-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 1/6
Verifying : postgresql96-server-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 2/6
Verifying : postgresql96-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 3/6
Verifying : postgresql96-contrib-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 4/6
Verifying : uuid-1.6.2-27.22.amzn1.x86_64 5/6
Verifying : postgresql96-devel-9.6.11-1.82.amzn1.x86_64 6/6

Installed:
postgresql96.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1 postgresql96-contrib.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1
postgresql96-devel.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1 postgresql96-libs.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1
postgresql96-server.x86_64 0:9.6.11-1.82.amzn1

Dependency Installed:
uuid.x86_64 0:1.6.2-27.22.amzn1

Complete!

[sairito0628]

$ bundle install
The dependency tzinfo-data (>= 0) will be unused by any of the platforms Bundler is installing for. Bundler is installing for ruby but the dependency is only for x86-mingw32, x86-mswin32, x64-mingw32, java. To add those platforms to the bundle, run `bundle lock --add-platform x86-mingw32 x86-mswin32 x64-mingw32 java`.
Fetching gem metadata from https://rubygems.org/............
Fetching gem metadata from https://rubygems.org/.
Resolving dependencies...
Using rake 12.3.2
Using concurrent-ruby 1.1.4
Using i18n 1.6.0
Using minitest 5.11.3
Using thread_safe 0.3.6
Using tzinfo 1.2.5
Using activesupport 5.2.2
Using builder 3.2.3
Using erubi 1.8.0
Using mini_portile2 2.4.0
Using nokogiri 1.10.1
Using rails-dom-testing 2.0.3
Using crass 1.0.4
Using loofah 2.2.3
Using rails-html-sanitizer 1.0.4
Using actionview 5.2.2
Using rack 2.0.6
Using rack-test 1.1.0
Using actionpack 5.2.2
Using nio4r 2.3.1
Using websocket-extensions 0.1.3
Using websocket-driver 0.7.0
Using actioncable 5.2.2
Using globalid 0.4.2
Using activejob 5.2.2
Using mini_mime 1.0.1
Using mail 2.7.1
Using actionmailer 5.2.2
Using activemodel 5.2.2
Using arel 9.0.0
Using activerecord 5.2.2
Using mimemagic 0.3.3
Using marcel 0.3.3
Using activestorage 5.2.2
Using public_suffix 3.0.3
Using addressable 2.6.0
Using bindex 0.5.0
Using bundler 2.0.1
Using byebug 11.0.0
Using xpath 3.2.0
Using capybara 2.18.0
Using ffi 1.10.0
Using childprocess 0.9.0
Using coffee-script-source 1.12.2
Using execjs 2.7.0
Using coffee-script 2.4.1
Using method_source 0.9.2
Using thor 0.20.3
Using railties 5.2.2
Using coffee-rails 4.2.2
Using multi_json 1.13.1
Using jbuilder 2.8.0
Using rb-fsevent 0.10.3
Using rb-inotify 0.10.0
Using ruby_dep 1.5.0
Using listen 3.1.5
Fetching pg 0.20.0
Installing pg 0.20.0 with native extensions
Gem::Ext::BuildError: ERROR: Failed to build gem native extension.

current directory: /home/ec2-user/.rvm/gems/ruby-2.5.3/gems/pg-0.20.0/ext
/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/bin/ruby -r ./siteconf20190312-4762-10tzglv.rb extconf.rb
--with-pg-config=/bin/none
Using config values from /bin/none
sh: /bin/none: No such file or directory
sh: /bin/none: No such file or directory
checking for libpq-fe.h... no
Can't find the 'libpq-fe.h header
*** extconf.rb failed ***
Could not create Makefile due to some reason, probably lack of necessary
libraries and/or headers. Check the mkmf.log file for more details. You may
need configuration options.

Provided configuration options:
--with-opt-dir
--without-opt-dir
--with-opt-include
--without-opt-include=${opt-dir}/include
--with-opt-lib
--without-opt-lib=${opt-dir}/lib
--with-make-prog
--without-make-prog
--srcdir=.
--curdir
--ruby=/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/bin/$(RUBY_BASE_NAME)
--with-pg
--without-pg
--enable-windows-cross
--disable-windows-cross
--with-pg-config
--with-pg-dir
--without-pg-dir
--with-pg-include
--without-pg-include=${pg-dir}/include
--with-pg-lib
--without-pg-lib=${pg-dir}/lib

To see why this extension failed to compile, please check the mkmf.log which can be found here:

/home/ec2-user/.rvm/gems/ruby-2.5.3/extensions/x86_64-linux/2.5.0/pg-0.20.0/mkmf.log

extconf failed, exit code 1

Gem files will remain installed in /home/ec2-user/.rvm/gems/ruby-2.5.3/gems/pg-0.20.0 for inspection.
Results logged to /home/ec2-user/.rvm/gems/ruby-2.5.3/extensions/x86_64-linux/2.5.0/pg-0.20.0/gem_make.out

An error occurred while installing pg (0.20.0), and Bundler cannot continue.
Make sure that `gem install pg -v '0.20.0' --source 'https://rubygems.org/'` succeeds before bundling.

In Gemfile:
pg

[sairito0628]

インストール後、再度bundle install するとまた同じように同じエラーが出てきてしまいます。。。

[kazto]

https://codeday.me/jp/qa/20181207/30432.html

pg_configというコマンドが見つからないと上手くいかない、という記事を見つけました。
`echo $PATH`の結果はどのようになっていますでしょうか。

[sairito0628]

ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ `echo $PATH`
bash: /usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/home/ec2-user/.rvm/gems/ruby-2.5.3/bin:/home/ec2-user/.rvm/gems/ruby-2.5.3@global/bin:/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/bin:/home/ec2-user/.nvm/versions/node/v6.16.0/bin:/usr/local/bin:/bin:/usr/bin:/home/ec2-user/.local/bin:/home/ec2-user/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/opt/aws/bin:/home/ec2-user/.local/bin:/home/ec2-user/bin:/home/ec2-user/.local/bin:/home/ec2-user/bin:/home/ec2-user/.rvm/bin: No such file or directory

[sairito0628]

こんな感じです。。。

[kazto]

/usr/pgsql-9.6/bin (9.6、の部分はご自身の環境に読み換えてください)あたりにpg_configコマンドが存在するはずなので、PATHを通してください。
PATHの通し方についてはご存知でしょうか。

[kazto]

くれぐれも、そのまんま鵜呑みにしてコピペせず、ご自身でlsコマンドで当該のディレクトリ、ファイルが存在することを確認してからPATHを通してください。

[sairito0628]

ec2-user:~/environment $ cd ~/environment/hello_app/
ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ psql --version
psql (PostgreSQL) 9.6.11
ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ which Is
/usr/bin/which: no Is in (/usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/home/ec2-user/.nvm/versions/node/v6.16.0/bin:/usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/usr/local/heroku/bin:/home/ec2-user/.rvm/gems/ruby-2.5.3/bin:/home/ec2-user/.rvm/gems/ruby-2.5.3@global/bin:/home/ec2-user/.rvm/rubies/ruby-2.5.3/bin:/usr/local/bin:/bin:/usr/bin:/home/ec2-user/.local/bin:/home/ec2-user/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/opt/aws/bin:/home/ec2-user/.local/bin:/home/ec2-user/bin:/home/ec2-user/.local/bin:/home/ec2-user/bin:/home/ec2-user/.rvm/bin:/opt/aws/bin:/home/ec2-user/.local/bin:/home/ec2-user/bin:/home/ec2-user/.local/bin:/home/ec2-user/bin)
ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ which ls
alias ls='ls --color=auto'
/bin/ls
ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ export PATH=$PATH:/usr/pgsql- 9.6.11/bin
bash: export: `9.6.11/bin': not a valid identifier
ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ export PATH=$PATH:/usr/pgsql-9.6/bin

[sairito0628]

PATHを通したことがなく、色々自分で調べながらやってみた結果が上記の内容になります。。
見よう見まねでやってみた結果なので、まだ理解が浅いところもありますが、
PATHの通し方はあっていますでしょうか・・・
9.6.11/binが無効と言われてしまいました。。

[kazto]

返信を見落としていました、すみません。
PATHの通し方、違いますね。。。

[kazto]

内容追記しました。

[sairito0628]

返信ありがとうございます。
$ ls /usrとすると
bin etc games include lib lib64 libexec local sbin share src tmp
と出てきてします。。。

[kazto]

ほう。では、
「rpm -ql postgresql96-devel | grep pg_config」の結果はどうなりますか？

[sairito0628]

$ rpm -ql postgresql96-devel | grep pg_config
/usr/include/pgsql96/ecpg_config.h
/usr/include/pgsql96/ecpg_config_x86_64.h
/usr/include/pgsql96/pg_config.h
/usr/include/pgsql96/pg_config_ext.h
/usr/include/pgsql96/pg_config_ext_x86_64.h
/usr/include/pgsql96/pg_config_manual.h
/usr/include/pgsql96/pg_config_os.h
/usr/include/pgsql96/pg_config_x86_64.h
/usr/include/pgsql96/server/pg_config.h
/usr/include/pgsql96/server/pg_config_ext.h
/usr/include/pgsql96/server/pg_config_ext_x86_64.h
/usr/include/pgsql96/server/pg_config_manual.h
/usr/include/pgsql96/server/pg_config_os.h
/usr/include/pgsql96/server/pg_config_x86_64.h

[sairito0628]

こうなりました！

Answer 2

どこで、何をしていてこのエラーが発生したのでしょうか？

質問には、「どこで、なにをして　どうなった。(ので、どうしたい。)」を具体的に記載していただけないでしょうか？

データベースは、EC2 に PostgreSQL をインストールしてあるのでしょうか？
それとも Amazon RDS for PostgreSQL を使うのでしょうか？

---

エラーメッセージからすると　おそらく、お使いの環境に PostgreSQL のヘッダファイルがインストールされていないのだと思われますが、お使いのサーバー環境が不明なので brew でインストールできるかは不明です。( brew は、macOS 用のパッケージマネージャです。)

エラーメッセージを見る限り EC2 のように見えるのですが... EC2 にインストールされている OS が不明ですが、 Amazon Linux なら 管理者権限で、yum install postgresql-devel あたりでしょうか。

なお、お使いのバージョンによっては、パッケージ名にバージョンが入っている場合もあるので、 yum list | grep postgre で PostgreSQL 関連のパッケージの一覧を確認して、必要なパッケージを選んでください。

Comments

[sairito0628]

ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ yum install postgresql-devel
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
You need to be root to perform this command.

[sairito0628]

ec2-user:~/environment/hello_app (master) $ yum list | grep postgre
postgresql92.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 @amzn-updates
postgresql92-devel.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 @amzn-updates
postgresql92-libs.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 @amzn-updates
asterisk-postgresql.x86_64 1.8.32.3-2.el6 epel
check_postgres.noarch 2.22.0-1.el6 epel
collectd-postgresql.x86_64 5.8.0-2.19.amzn1 amzn-main
freeradius-postgresql.x86_64 2.2.6-7.16.amzn1 amzn-main
lua-sql-postgresql.x86_64 2.1.1-7.el6 epel
opendbx-postgresql.x86_64 1.4.6-6.el6 epel
opensips-postgresql.x86_64 1.7.2-2.el6 epel
pdns-backend-postgresql.x86_64 3.3.3-2.el6 epel
postgresql-ip4r.x86_64 1.05-1.el6 epel
postgresql-jdbc.noarch 8.4.701-8.11.amzn1 amzn-main
postgresql-odbc.x86_64 08.04.0200-1.6.amzn1 amzn-main
postgresql-pgpool-II.i686 3.2.15-1.el6 epel
postgresql-pgpool-II.x86_64 3.2.15-1.el6 epel
postgresql-pgpool-II-devel.i686 3.2.15-1.el6 epel
postgresql-pgpool-II-devel.x86_64 3.2.15-1.el6 epel
postgresql-pgpool-II-recovery.x86_64 3.2.15-1.el6 epel
postgresql-plruby.x86_64 0.5.3-4.el6 epel
postgresql-plruby-doc.x86_64 0.5.3-4.el6 epel
postgresql8.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-contrib.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-devel.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-docs.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-libs.i686 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-libs.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-plperl.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-plpython.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-pltcl.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-server.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql8-test.x86_64 8.4.20-5.52.amzn1 amzn-main
postgresql92-contrib.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-docs.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-libs.i686 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-plperl.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-plpython26.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-plpython27.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-pltcl.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-server.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-server-compat.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql92-test.x86_64 9.2.24-2.66.amzn1 amzn-updates
postgresql93.x86_64 9.3.25-1.72.amzn1 amzn-updates
postgresql93-contrib.x86_64 9.3.25-1.72.amzn1 amzn-updates
postgresql93-devel.x86_64 9.3.25-1.72.amzn1 amzn-updates
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[sairito0628]

説明不足で大変申し訳ございません。
どのosをインストールされているかなど再度確認した上でまたお返事させていただきます。