質問をすることでしか得られない、回答やアドバイスがある。

15分調べてもわからないことは、質問しよう!

ただいまの
回答率

87.59%

netCDFのファイルに対してgetメソッドを使用し、値が無い場合にnoneを返したい(python)

解決済

回答 2

投稿 編集

  • 評価
  • クリップ 0
  • VIEW 1,458

score 53

前提・実現したいこと

下記のソースコードを実行し、csvに出力&mapを描画という結果を得ようとしています。

発生している問題・エラーメッセージ

ファイルを実行した際に、下記のように'lightning_flash_lat'が無いと言われてしまいます。しかし、'lightning_flash_lat'が無い場合でも、何も無い値で(空欄で)csvを出力したい場合、どのようにコードを書き換えれば良いでしょうか?

  File "kaminaridama_min_variables.py", line 70, in <module>
    flash_lat = np.concatenate([flash_lat,datafile.variables['lightning_flash_lat'][:]])
KeyError: 'lightning_flash_lat'

該当のソースコード

# -*- coding: utf-8 -*-

#### Import Python packages ####
import numpy as np
import glob
from netCDF4 import Dataset
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.basemap import Basemap
import csv
try:
    # Python 2
    from itertools import izip
except ImportError:
    # Python 3
    izip = zip
import datetime

default_time = datetime.datetime(1993, 1, 1, 00, 00, 00)

dataDir = '/Users/hoge/2019/0208/'
csvfile = "/Users/hoge/isslis_flashloc_test.csv" 

#Identify all NetCDF files in the directory
files = glob.glob(dataDir+'*.nc')

flash_lat = np.array([])
flash_lon = np.array([])

for i in files:
    datafile = Dataset(i)

    flash_lat = np.concatenate([flash_lat,datafile.variables['lightning_flash_lat'][:]])
    flash_lon = np.concatenate([flash_lon,datafile.variables['lightning_flash_lon'][:]])

with open(csvfile, 'w') as myfile:
    writer = csv.writer(myfile)
    writer.writerows(izip(["flash_lat"], ["flash_lon"]))

    writer.writerows(izip(flash_lat, flash_lon))

#Create plot of lightning flash location heat map
plt.figure(figsize=((20,20))) #Set plot dimensions
map = Basemap(projection='cyl', lon_0 = 0, resolution='c')
lightning = map.hexbin(flash_lon, flash_lat, gridsize=300,bins='log',cmap='jet',mincnt=1,zorder=10) #Bin flash counts into hexbins using a gridsize of your choice

#Draw geographic boundaries and meridians/parallels
map.drawmapboundary(fill_color='k')
map.fillcontinents(color='grey',lake_color='grey')
map.drawcoastlines(color='white')
map.drawcountries(color='white')
map.drawmeridians(np.arange(0,390,30), labels=[0,0,0,1],fontsize=10, color="lightgray")
map.drawparallels(np.arange(-90,120,30), labels=[1,0,0,0],fontsize=10, color="lightgray")

cbar = map.colorbar(lightning,location='bottom',pad="5%")
cbar.set_label('Flash Count') #Remember to change label

plt.title('ISS LIS Detected Lightning Flash Locations January 4, 2018', fontsize = 18) #Rember to change title


plt.show()

試したこと

下記を試しましたが、そもそもdatafileがnetCDFであるため、下記を実施してみても「AttributeError: NetCDF: Attribute not found」とエラーが返ってきてしまいます。

    datafile.get('lightning_flash_lat', 'none')
  • 気になる質問をクリップする

    クリップした質問は、後からいつでもマイページで確認できます。

    またクリップした質問に回答があった際、通知やメールを受け取ることができます。

    クリップを取り消します

  • 良い質問の評価を上げる

    以下のような質問は評価を上げましょう

    • 質問内容が明確
    • 自分も答えを知りたい
    • 質問者以外のユーザにも役立つ

    評価が高い質問は、TOPページの「注目」タブのフィードに表示されやすくなります。

    質問の評価を上げたことを取り消します

  • 評価を下げられる数の上限に達しました

    評価を下げることができません

    • 1日5回まで評価を下げられます
    • 1日に1ユーザに対して2回まで評価を下げられます

    質問の評価を下げる

    teratailでは下記のような質問を「具体的に困っていることがない質問」、「サイトポリシーに違反する質問」と定義し、推奨していません。

    • プログラミングに関係のない質問
    • やってほしいことだけを記載した丸投げの質問
    • 問題・課題が含まれていない質問
    • 意図的に内容が抹消された質問
    • 過去に投稿した質問と同じ内容の質問
    • 広告と受け取られるような投稿

    評価が下がると、TOPページの「アクティブ」「注目」タブのフィードに表示されにくくなります。

    質問の評価を下げたことを取り消します

    この機能は開放されていません

    評価を下げる条件を満たしてません

    評価を下げる理由を選択してください

    詳細な説明はこちら

    上記に当てはまらず、質問内容が明確になっていない質問には「情報の追加・修正依頼」機能からコメントをしてください。

    質問の評価を下げる機能の利用条件

    この機能を利用するためには、以下の事項を行う必要があります。

回答 2

checkベストアンサー

+1

そのライブラリに関する知識はまったくありませんが、datafile.getではなくdatafile.variables.getで叩くべきなのでは。

KeyErrorをraiseしてくるならdatafile.variablesそのものは辞書likeなオブジェクトであると期待できる気がします。

どうしても駄目なら、

def f(d, k, default="none"):
    try:
        return d[k]
    except KeyError:
        return default

みたいなのを書いて使う手はあります。

投稿

編集

  • 回答の評価を上げる

    以下のような回答は評価を上げましょう

    • 正しい回答
    • わかりやすい回答
    • ためになる回答

    評価が高い回答ほどページの上位に表示されます。

  • 回答の評価を下げる

    下記のような回答は推奨されていません。

    • 間違っている回答
    • 質問の回答になっていない投稿
    • スパムや攻撃的な表現を用いた投稿

    評価を下げる際はその理由を明確に伝え、適切な回答に修正してもらいましょう。

+1

まずはドキュメントをよく読んで、試してみてはいかがでしょうか。
エラーになったとしても怪我をするわけでもないですし。

http://unidata.github.io/netcdf4-python/

以下のような感じでどのような要素があるか確認できるのではないでしょうか。
確認した上で、データがあるか否かはsizeでチェックできるのではないかと。

for dimobj in datafile.dimensions.values():
    print dimobj

投稿

  • 回答の評価を上げる

    以下のような回答は評価を上げましょう

    • 正しい回答
    • わかりやすい回答
    • ためになる回答

    評価が高い回答ほどページの上位に表示されます。

  • 回答の評価を下げる

    下記のような回答は推奨されていません。

    • 間違っている回答
    • 質問の回答になっていない投稿
    • スパムや攻撃的な表現を用いた投稿

    評価を下げる際はその理由を明確に伝え、適切な回答に修正してもらいましょう。

15分調べてもわからないことは、teratailで質問しよう!

  • ただいまの回答率 87.59%
  • 質問をまとめることで、思考を整理して素早く解決
  • テンプレート機能で、簡単に質問をまとめられる

関連した質問

同じタグがついた質問を見る